More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0177 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0177  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
389 aa  781    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.225729  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  63.17 
 
 
403 aa  518  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  62.66 
 
 
403 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  63.17 
 
 
395 aa  511  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  63.78 
 
 
396 aa  513  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  62.66 
 
 
399 aa  508  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  62.72 
 
 
398 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  62.66 
 
 
399 aa  508  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  62.72 
 
 
398 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  62.66 
 
 
399 aa  510  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  62.15 
 
 
399 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  62.15 
 
 
399 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  62.15 
 
 
399 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  62.4 
 
 
399 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  62.05 
 
 
396 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  61.89 
 
 
399 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  61.89 
 
 
399 aa  504  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  63.33 
 
 
397 aa  503  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  61.89 
 
 
399 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  62.15 
 
 
396 aa  503  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  61.89 
 
 
399 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  61.79 
 
 
396 aa  504  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  62.82 
 
 
391 aa  501  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  62.82 
 
 
391 aa  501  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  60.47 
 
 
406 aa  496  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  59.9 
 
 
393 aa  495  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  61.08 
 
 
395 aa  496  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  60.47 
 
 
402 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  61.72 
 
 
402 aa  492  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  61.79 
 
 
396 aa  491  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  59.18 
 
 
405 aa  488  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  59.69 
 
 
406 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  59.43 
 
 
406 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  60.1 
 
 
395 aa  491  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  60.1 
 
 
395 aa  491  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  59.54 
 
 
405 aa  486  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  60.15 
 
 
399 aa  486  1e-136  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  61.13 
 
 
399 aa  486  1e-136  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  60.15 
 
 
396 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  58.42 
 
 
405 aa  482  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  58.82 
 
 
396 aa  483  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  59.44 
 
 
414 aa  483  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  59.23 
 
 
393 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  59.54 
 
 
395 aa  477  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  59.14 
 
 
401 aa  476  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  57.58 
 
 
396 aa  475  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  59.9 
 
 
397 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  60.71 
 
 
402 aa  477  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  61.18 
 
 
395 aa  472  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  56.59 
 
 
395 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  54.38 
 
 
395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  58.66 
 
 
403 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3661  S-adenosylmethionine synthetase  59.33 
 
 
393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.284553  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  58.4 
 
 
403 aa  466  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1880  S-adenosylmethionine synthetase  58.18 
 
 
387 aa  463  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  59.37 
 
 
389 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000134106  hitchhiker  0.0000021958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  60.42 
 
 
389 aa  461  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1697  S-adenosylmethionine synthetase  60.41 
 
 
385 aa  461  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  58.06 
 
 
398 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  56.51 
 
 
388 aa  460  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  58.46 
 
 
402 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  58.1 
 
 
397 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0367  S-adenosylmethionine synthetase  57.4 
 
 
389 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  57.88 
 
 
388 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2131  S-adenosylmethionine synthetase  55.32 
 
 
393 aa  456  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0780  S-adenosylmethionine synthetase  56.9 
 
 
420 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000106532  hitchhiker  0.000013186 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0053  S-adenosylmethionine synthetase  55.58 
 
 
393 aa  457  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1341  S-adenosylmethionine synthetase  59.37 
 
 
389 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2943  S-adenosylmethionine synthetase  59.37 
 
 
389 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  54.03 
 
 
389 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  55.7 
 
 
384 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  55.7 
 
 
384 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  57.14 
 
 
397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0795  S-adenosylmethionine synthetase  57.37 
 
 
394 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.50978e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  56.77 
 
 
389 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  55.96 
 
 
384 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  55.18 
 
 
387 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  56.22 
 
 
383 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  56.22 
 
 
383 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2256  S-adenosylmethionine synthetase  57.44 
 
 
411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0616987  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  56.22 
 
 
383 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  55.7 
 
 
384 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  55.96 
 
 
383 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  57.11 
 
 
388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  55.96 
 
 
384 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  55.96 
 
 
384 aa  450  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  55.7 
 
 
383 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  55.96 
 
 
384 aa  450  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  55.7 
 
 
383 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  55.96 
 
 
384 aa  450  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  55.96 
 
 
384 aa  450  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  55.58 
 
 
390 aa  449  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  55.96 
 
 
384 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  55.7 
 
 
383 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  55.7 
 
 
384 aa  448  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  55.96 
 
 
384 aa  450  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  55.96 
 
 
383 aa  448  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  55.7 
 
 
384 aa  449  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  55.96 
 
 
384 aa  450  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  55.7 
 
 
384 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>