49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1313 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1313  phage shock protein A, PspA  100 
 
 
208 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1157  phage shock protein A, PspA  42.93 
 
 
220 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3852  PspA/IM30 family protein  42.44 
 
 
220 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740704  hitchhiker  0.00000000000675972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1560  PspA/IM30 family protein  41.46 
 
 
220 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000688756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1598  PspA/IM30 family protein  41.46 
 
 
220 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000566906  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1528  PspA/IM30 family protein  41.46 
 
 
220 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70975e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1345  PspA/IM30 family protein  41.46 
 
 
220 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1318  PspA/IM30 family protein  41.46 
 
 
220 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1454  PspA/IM30 family protein  41.46 
 
 
220 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000577339  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1319  PspA/IM30 family protein  41.46 
 
 
220 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1492  PspA/IM30 family protein  41.46 
 
 
220 aa  148  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00023246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1360  phage shock protein A, PspA  40.98 
 
 
220 aa  148  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.320974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1034  PspA/IM30 family protein  29.33 
 
 
222 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.510528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0842  phage shock protein A, PspA  28.37 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  28.65 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  28.65 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  28.65 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  28.65 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  28.65 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  28.65 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  28.65 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  28.65 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  28.65 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  28.65 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  28.65 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1204  phage shock protein A, PspA  29.73 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  26.24 
 
 
221 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  22.4 
 
 
221 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  27.51 
 
 
259 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  27.32 
 
 
254 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  30.73 
 
 
255 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  26.55 
 
 
258 aa  54.7  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  23.5 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  29.2 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5874  phage shock protein A, PspA  28.19 
 
 
234 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  29.61 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  22.83 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  25.33 
 
 
254 aa  49.3  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  23.76 
 
 
227 aa  48.9  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0207  phage shock protein A, PspA  25.37 
 
 
220 aa  48.9  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761137  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  22.1 
 
 
319 aa  45.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  25.81 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  25.81 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  29.02 
 
 
221 aa  45.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  24.73 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  27.5 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  27.27 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4182  phage shock protein A, PspA  26.71 
 
 
220 aa  41.6  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179284  hitchhiker  0.000596951 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2745  phage shock protein A, PspA  23.21 
 
 
268 aa  41.6  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0150152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>