104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2166 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2166  spore germination protein  100 
 
 
370 aa  740    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.444413  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0136  spore germination protein  56.55 
 
 
365 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00122585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3656  spore germination protein  54.29 
 
 
365 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0603  spore germination protein  30.94 
 
 
363 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2279  spore germination protein  33.43 
 
 
361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0296  spore germination protein  31.56 
 
 
385 aa  194  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1460  spore germination protein  33.33 
 
 
363 aa  189  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0781  spore germination protein  33.04 
 
 
360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173787  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2041  spore germination protein  30.43 
 
 
365 aa  183  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0802  spore germination protein  30.06 
 
 
369 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1192  hypothetical protein  29.4 
 
 
366 aa  169  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0135  spore germination protein KB  31.25 
 
 
363 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0786336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0055  spore germination protein  31.97 
 
 
369 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3655  spore germination protein  32.04 
 
 
364 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3200  hypothetical membrane protein  32.42 
 
 
366 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2565  spore germination protein  29.72 
 
 
357 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.760269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2466  spore germination protein  29 
 
 
367 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3365  spore germination protein  30.58 
 
 
360 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000593195  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2766  spore germination protein  27.1 
 
 
368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000369492  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0051  spore germination protein  27.07 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0844  spore germination protein  26.32 
 
 
364 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3011  spore germination protein  25.8 
 
 
368 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2711  spore germination protein  24.52 
 
 
356 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0873  spore germination protein  26.88 
 
 
362 aa  123  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00110  spore germination protein  27.04 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3166  spore germination protein A2  26.1 
 
 
363 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2852  spore germination protein; amino acid permease  26.1 
 
 
363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000387723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2102  spore germination protein A2  25.51 
 
 
363 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3137  spore germination protein A2  25.81 
 
 
363 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3283  spore germination protein  29.11 
 
 
368 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0604  spore germination protein  24.04 
 
 
369 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3159  spore germination protein A2  25.66 
 
 
363 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165697 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2903  spore germination protein  25.66 
 
 
363 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0439  spore germination protein  22.22 
 
 
374 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0079  hypothetical protein  26.16 
 
 
374 aa  97.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1011  spore germination protein  27.12 
 
 
361 aa  96.7  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2954  spore germination protein  24.48 
 
 
364 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0670  spore germination protein  25.07 
 
 
365 aa  96.3  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3073  spore germination protein  25.63 
 
 
366 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2435  spore germination protein  25.14 
 
 
365 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0074  hypothetical protein  24.13 
 
 
365 aa  93.6  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1955  spore germination protein  22.68 
 
 
368 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.226978  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1012  spore germination protein  24.47 
 
 
359 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000935312 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2457  spore germination protein  26.8 
 
 
359 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0522  Spore germination protein  23.71 
 
 
367 aa  84  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.234591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1733  spore germination protein  22.16 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0363147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0652  spore germination protein  23.87 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1970  spore germination protein  21.98 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1561  spore germination protein  24.57 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.636005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0668  spore germination protein  24.21 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2927  spore germination protein  23.74 
 
 
306 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0058  spore germination protein  23.89 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.962325  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0156  spore germination protein xb  22.56 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5574  spore germination protein  24.52 
 
 
367 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.300189 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2664  spore germination protein  26.55 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0764  spore germination protein GerLB  24 
 
 
374 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000950494 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0676  spore germination protein GerLB  24 
 
 
374 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2665  spore germination protein  23.08 
 
 
377 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0779  spore germination protein GerLB  24 
 
 
374 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.56621  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0620  spore germination protein (amino acid permease)  23.47 
 
 
374 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0664  spore germination protein  21.99 
 
 
363 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2459  spore germination protein  23.81 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0620  spore germination protein (amino acid permease)  23.73 
 
 
374 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0246676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2754  spore germination protein XB  21.75 
 
 
363 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0830054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2063  spore germination protein  23.5 
 
 
373 aa  59.7  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.722464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3583  spore germination protein  24.4 
 
 
365 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3283  spore germination protein; amino acid permease  24.4 
 
 
365 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.946646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3370  spore germination protein  24.4 
 
 
365 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3634  spore germination protein  24.4 
 
 
365 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3600  spore germination protein  24.8 
 
 
365 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3591  spore germination protein  24.8 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0710  spore germination protein GerLB  24.05 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1937  spore germination protein  22.66 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3683  spore germination protein  25.74 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4593  spore germination protein GerLB  24.14 
 
 
374 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0838  spore germination protein GerLB  24.35 
 
 
374 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0744  spore germination protein GerLB  24.2 
 
 
374 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0224  spore germination protein XB  22.35 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000100251 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0625  spore germination protein  24.87 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2837  hypothetical protein  28.14 
 
 
182 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1633  spore germination protein  23.78 
 
 
365 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0598  spore germination protein  22.79 
 
 
371 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3333  spore germination protein; amino acid permease  22.19 
 
 
365 aa  49.7  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0832  spore germination protein GerYB  21.4 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.11818e-54 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0675  GerB family spore germination protein  21.4 
 
 
369 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0663  spore germination protein B  21.03 
 
 
369 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0547  spore germination protein  22.87 
 
 
368 aa  46.6  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0235  spore germination protein  20.4 
 
 
364 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0702  spore germination protein GerKB  24.61 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4517  GerAB  22.63 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0243006 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4667  spore germination protein GerKB  23.39 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0200  spore germination protein B  21.18 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0675  spore germination protein  20.66 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3120  spore germination protein QB  21.83 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4564  spore germination protein  21.55 
 
 
364 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1964  Spore germination protein  22.49 
 
 
391 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0777355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0601  spore germination protein GerKB  23.01 
 
 
368 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0545  spore germination protein  23.01 
 
 
368 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2887  GerB family spore germination protein  21.83 
 
 
360 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.070382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0545  spore germination protein KB  23.01 
 
 
368 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>