81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0664 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0664  spore germination protein  100 
 
 
363 aa  719    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2102  spore germination protein A2  24.78 
 
 
363 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3137  spore germination protein A2  24.02 
 
 
363 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2852  spore germination protein; amino acid permease  24.17 
 
 
363 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000387723  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3166  spore germination protein A2  24.17 
 
 
363 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3159  spore germination protein A2  23.15 
 
 
363 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165697 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2903  spore germination protein  22.73 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161423  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5574  spore germination protein  23.57 
 
 
367 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.300189 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0598  spore germination protein  23.51 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2665  spore germination protein  29.6 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2664  spore germination protein  28.67 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0620  spore germination protein (amino acid permease)  20.94 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0246676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0764  spore germination protein GerLB  20.94 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000950494 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3283  spore germination protein  24.2 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764242  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2457  spore germination protein  25.42 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0676  spore germination protein GerLB  20.66 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0779  spore germination protein GerLB  22.3 
 
 
374 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.56621  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0620  spore germination protein (amino acid permease)  20.66 
 
 
374 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4593  spore germination protein GerLB  22.3 
 
 
374 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2279  spore germination protein  23.03 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2565  spore germination protein  22.44 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.760269 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0744  spore germination protein GerLB  22.3 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0838  spore germination protein GerLB  22.65 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0625  spore germination protein  23 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00110  spore germination protein  22.53 
 
 
365 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2927  spore germination protein  26.24 
 
 
306 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0832  spore germination protein GerYB  23.98 
 
 
369 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.11818e-54 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1955  spore germination protein  22.79 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.226978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0663  spore germination protein B  24.86 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3200  hypothetical membrane protein  24.41 
 
 
366 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0603  spore germination protein  23.18 
 
 
363 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0710  spore germination protein GerLB  20.88 
 
 
343 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4517  GerAB  24.26 
 
 
369 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0243006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0604  spore germination protein  22.95 
 
 
369 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0873  spore germination protein  22.86 
 
 
362 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0051  spore germination protein  26.44 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2166  spore germination protein  21.99 
 
 
370 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.444413  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0135  spore germination protein KB  26.33 
 
 
363 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0786336  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1561  spore germination protein  25 
 
 
368 aa  56.6  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.636005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0675  spore germination protein  22.91 
 
 
369 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3683  spore germination protein  23.32 
 
 
365 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4667  spore germination protein GerKB  22.46 
 
 
368 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0136  spore germination protein  22.68 
 
 
365 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00122585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3333  spore germination protein; amino acid permease  22.19 
 
 
365 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1012  spore germination protein  23.78 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000935312 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0634  spore germination protein GerKB  22.73 
 
 
368 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0545  spore germination protein KB  22.73 
 
 
368 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0690  spore germination protein GerKB  22.73 
 
 
368 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0545  spore germination protein  22.73 
 
 
368 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0601  spore germination protein GerKB  22.73 
 
 
368 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0817  spore germination protein, GerB family  22.3 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0924  spore germination protein, GerB family  21.86 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3634  spore germination protein  22.19 
 
 
365 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3583  spore germination protein  22.19 
 
 
365 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1633  spore germination protein  23.96 
 
 
365 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3370  spore germination protein  22.19 
 
 
365 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0826  spore germination protein  24.51 
 
 
369 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.724874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3600  spore germination protein  23.89 
 
 
365 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3283  spore germination protein; amino acid permease  22.19 
 
 
365 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.946646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0670  spore germination protein GerKB  23.48 
 
 
368 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3591  spore germination protein  23.89 
 
 
365 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0547  spore germination protein  22.46 
 
 
368 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2466  spore germination protein  24.17 
 
 
367 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2041  spore germination protein  21.68 
 
 
365 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0702  spore germination protein GerKB  22.96 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0802  spore germination protein  21.87 
 
 
369 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0079  hypothetical protein  22.73 
 
 
374 aa  49.7  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3656  spore germination protein  22.3 
 
 
365 aa  49.7  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0781  spore germination protein  23.02 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173787  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0652  spore germination protein  23.31 
 
 
361 aa  47  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3365  spore germination protein  30.3 
 
 
360 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000593195  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2711  spore germination protein  28.06 
 
 
356 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0844  spore germination protein  22.73 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3655  spore germination protein  24.45 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0296  spore germination protein  22.79 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3409  spore germination protein  20.15 
 
 
364 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 
454 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2340  spore germination protein  23.67 
 
 
367 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00328418  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0235  spore germination protein  23.76 
 
 
364 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2766  spore germination protein  20.42 
 
 
368 aa  42.7  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000369492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0670  spore germination protein  26.52 
 
 
365 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>