59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0051 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0051  spore germination protein  100 
 
 
359 aa  713    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2565  spore germination protein  33.33 
 
 
357 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.760269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3365  spore germination protein  35.85 
 
 
360 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000593195  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1460  spore germination protein  31.35 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1192  hypothetical protein  28.57 
 
 
366 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2166  spore germination protein  27.07 
 
 
370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.444413  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0136  spore germination protein  26.92 
 
 
365 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00122585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3656  spore germination protein  26.74 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2279  spore germination protein  28.73 
 
 
361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3011  spore germination protein  24.72 
 
 
368 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2466  spore germination protein  26.92 
 
 
367 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0781  spore germination protein  26.8 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173787  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0296  spore germination protein  26.18 
 
 
385 aa  109  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2041  spore germination protein  28.82 
 
 
365 aa  105  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0844  spore germination protein  26.36 
 
 
364 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0135  spore germination protein KB  26.47 
 
 
363 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0786336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3655  spore germination protein  26.58 
 
 
364 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0873  spore germination protein  27.1 
 
 
362 aa  87.4  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0055  spore germination protein  23.59 
 
 
369 aa  85.9  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0603  spore germination protein  24.64 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2102  spore germination protein A2  26.3 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2852  spore germination protein; amino acid permease  26.3 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000387723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3137  spore germination protein A2  26.3 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3166  spore germination protein A2  26.3 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2903  spore germination protein  25.99 
 
 
363 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3159  spore germination protein A2  26.3 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165697 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0802  spore germination protein  25.21 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0074  hypothetical protein  23.84 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1012  spore germination protein  26.94 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000935312 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2927  spore germination protein  27.32 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2711  spore germination protein  25.07 
 
 
356 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3283  spore germination protein  25.2 
 
 
368 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764242  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3200  hypothetical membrane protein  28.08 
 
 
366 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3073  spore germination protein  26.88 
 
 
366 aa  63.5  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1011  spore germination protein  25.53 
 
 
361 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2766  spore germination protein  25.13 
 
 
368 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000369492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0664  spore germination protein  26.44 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0652  spore germination protein  25.72 
 
 
361 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2665  spore germination protein  28.35 
 
 
377 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00110  spore germination protein  26.24 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0058  spore germination protein  27.6 
 
 
370 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.962325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2457  spore germination protein  26.55 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2837  hypothetical protein  27.33 
 
 
182 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0702  spore germination protein GerKB  27.55 
 
 
369 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4667  spore germination protein GerKB  21.27 
 
 
368 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1561  spore germination protein  27.08 
 
 
368 aa  49.7  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.636005  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1955  spore germination protein  24.46 
 
 
368 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.226978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2664  spore germination protein  25.38 
 
 
362 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0634  spore germination protein GerKB  22.59 
 
 
368 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0690  spore germination protein GerKB  22.59 
 
 
368 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0545  spore germination protein  22.59 
 
 
368 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0601  spore germination protein GerKB  22.59 
 
 
368 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0545  spore germination protein KB  22.59 
 
 
368 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0668  spore germination protein  23.1 
 
 
369 aa  47  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0670  spore germination protein GerKB  22.31 
 
 
368 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0547  spore germination protein  21.55 
 
 
368 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0079  hypothetical protein  27.94 
 
 
374 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1970  spore germination protein  21.69 
 
 
370 aa  43.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0675  spore germination protein  25.62 
 
 
369 aa  42.7  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>