36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0074 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0074  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  713    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1192  hypothetical protein  26.76 
 
 
366 aa  104  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3655  spore germination protein  23.51 
 
 
364 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2466  spore germination protein  25 
 
 
367 aa  99.8  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0844  spore germination protein  26.2 
 
 
364 aa  99.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0135  spore germination protein KB  23.72 
 
 
363 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0786336  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2166  spore germination protein  24.13 
 
 
370 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.444413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2041  spore germination protein  26.85 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2279  spore germination protein  27.92 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1460  spore germination protein  25.28 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3656  spore germination protein  23.95 
 
 
365 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0603  spore germination protein  25.68 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2565  spore germination protein  22.71 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.760269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0051  spore germination protein  23.84 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3011  spore germination protein  20.92 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0781  spore germination protein  24.09 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173787  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0136  spore germination protein  21.75 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00122585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1011  spore germination protein  24.03 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0670  spore germination protein  27.44 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1970  spore germination protein  26.57 
 
 
370 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3365  spore germination protein  24.58 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000593195  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0296  spore germination protein  23.1 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1733  spore germination protein  25 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0363147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0055  spore germination protein  24.4 
 
 
369 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3200  hypothetical membrane protein  23.26 
 
 
366 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0058  spore germination protein  28.4 
 
 
370 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.962325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2711  spore germination protein  20.9 
 
 
356 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2664  spore germination protein  25.5 
 
 
362 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2837  hypothetical protein  26.83 
 
 
182 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260649  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2665  spore germination protein  22.54 
 
 
377 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00110  spore germination protein  23.77 
 
 
365 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0652  spore germination protein  22.54 
 
 
361 aa  46.2  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3073  spore germination protein  20.32 
 
 
366 aa  43.9  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1012  spore germination protein  26.37 
 
 
359 aa  43.1  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000935312 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0522  Spore germination protein  21.6 
 
 
367 aa  43.1  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.234591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0547  spore germination protein  21 
 
 
368 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>