50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0668 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0668  spore germination protein  100 
 
 		 369 aa  709    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0670  spore germination protein  44.26 
 
 		 365 aa  325  5e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0522  Spore germination protein  35.58 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.234591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1970  spore germination protein  32.31 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0439  spore germination protein  27.97 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1733  spore germination protein  29.1 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0363147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2954  spore germination protein  29.76 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1937  spore germination protein  25.92 
 
 		 363 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2279  spore germination protein  25 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2041  spore germination protein  26.74 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0604  spore germination protein  24.53 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2166  spore germination protein  24.21 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.444413  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3011  spore germination protein  23.54 
 
 		 368 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0296  spore germination protein  21.81 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0055  spore germination protein  22.13 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3656  spore germination protein  21.35 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2766  spore germination protein  22.88 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000369492  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0873  spore germination protein  24.53 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1460  spore germination protein  23.81 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3655  spore germination protein  23.71 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0603  spore germination protein  23.39 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0136  spore germination protein  19.93 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00122585  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0135  spore germination protein KB  23.48 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0786336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0079  hypothetical protein  26.79 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1012  spore germination protein  23.8 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000935312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0744  spore germination protein GerLB  24.3 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0625  spore germination protein  25.41 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1192  hypothetical protein  22.7 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4593  spore germination protein GerLB  24.3 
 
 		 374 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0838  spore germination protein GerLB  23.68 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0844  spore germination protein  25.14 
 
 		 364 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0676  spore germination protein GerLB  24.31 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1955  spore germination protein  22.13 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.226978  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0802  spore germination protein  22.89 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0779  spore germination protein GerLB  24.31 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.56621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0710  spore germination protein GerLB  24.31 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0598  spore germination protein  19.53 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0051  spore germination protein  23.1 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3200  hypothetical membrane protein  22.03 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0764  spore germination protein GerLB  24.03 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000950494 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0620  spore germination protein (amino acid permease)  24.03 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0246676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0620  spore germination protein (amino acid permease)  23.33 
 
 		 374 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3283  spore germination protein  18.95 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764242  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3137  spore germination protein A2  23.49 
 
 		 363 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2852  spore germination protein; amino acid permease  23.49 
 
 		 363 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000387723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2102  spore germination protein A2  24.1 
 
 		 363 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0817  spore germination protein, GerB family  22.88 
 
 		 369 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2711  spore germination protein  23.78 
 
 		 356 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4517  GerAB  23.13 
 
 		 369 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0243006 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3166  spore germination protein A2  23.49 
 
 		 363 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>