41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1937 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1937  spore germination protein  100 
 
 
363 aa  687    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1970  spore germination protein  27.3 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2954  spore germination protein  31.1 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0670  spore germination protein  26.33 
 
 
365 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0439  spore germination protein  26.12 
 
 
374 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0668  spore germination protein  25.92 
 
 
369 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1733  spore germination protein  28.22 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0363147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0522  Spore germination protein  23.9 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.234591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2279  spore germination protein  24.09 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3656  spore germination protein  24.26 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0604  spore germination protein  25.35 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2041  spore germination protein  27.62 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0136  spore germination protein  24.59 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00122585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3655  spore germination protein  24.38 
 
 
364 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1561  spore germination protein  29.11 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.636005  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0296  spore germination protein  26.04 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2466  spore germination protein  25.5 
 
 
367 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0603  spore germination protein  27.52 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2166  spore germination protein  22.66 
 
 
370 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.444413  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1192  hypothetical protein  24.56 
 
 
366 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3073  spore germination protein  27.47 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1460  spore germination protein  26.25 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0135  spore germination protein KB  24.11 
 
 
363 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0786336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0079  hypothetical protein  22.8 
 
 
374 aa  56.6  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3137  spore germination protein A2  21.83 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0844  spore germination protein  24.74 
 
 
364 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3166  spore germination protein A2  21.48 
 
 
363 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2102  spore germination protein A2  21.83 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2852  spore germination protein; amino acid permease  21.83 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000387723  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2766  spore germination protein  21.18 
 
 
368 aa  53.1  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000369492  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00110  spore germination protein  21.12 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0873  spore germination protein  21.81 
 
 
362 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3011  spore germination protein  23.02 
 
 
368 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0781  spore germination protein  23.02 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173787  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3159  spore germination protein A2  22.18 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165697 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2903  spore germination protein  22.18 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161423  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5574  spore germination protein  22.58 
 
 
367 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.300189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0058  spore germination protein  27.73 
 
 
370 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.962325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0055  spore germination protein  21.71 
 
 
369 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2711  spore germination protein  22.61 
 
 
356 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1012  spore germination protein  22.91 
 
 
359 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000935312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>