42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0522 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0522  Spore germination protein  100 
 
 
367 aa  724    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.234591  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0670  spore germination protein  34.99 
 
 
365 aa  236  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0668  spore germination protein  35.58 
 
 
369 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1970  spore germination protein  27.76 
 
 
370 aa  119  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0439  spore germination protein  23.18 
 
 
374 aa  112  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1733  spore germination protein  25.76 
 
 
369 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0363147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2954  spore germination protein  24.69 
 
 
364 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1937  spore germination protein  23.82 
 
 
363 aa  90.1  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2279  spore germination protein  21.33 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2711  spore germination protein  26.37 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3656  spore germination protein  22.81 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2166  spore germination protein  24.04 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.444413  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3011  spore germination protein  26.97 
 
 
368 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2041  spore germination protein  22.43 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1012  spore germination protein  25.48 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000935312 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0136  spore germination protein  21.62 
 
 
365 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00122585  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1192  hypothetical protein  23.57 
 
 
366 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1460  spore germination protein  26.25 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1955  spore germination protein  18.96 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.226978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0844  spore germination protein  25.88 
 
 
364 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3283  spore germination protein  23.21 
 
 
368 aa  59.7  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764242  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0079  hypothetical protein  23.84 
 
 
374 aa  58.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0604  spore germination protein  21.62 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0058  spore germination protein  30.2 
 
 
370 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.962325  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0296  spore germination protein  18.6 
 
 
385 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0603  spore germination protein  22 
 
 
363 aa  56.6  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0055  spore germination protein  22.26 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3655  spore germination protein  18.56 
 
 
364 aa  53.5  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0224  spore germination protein XB  28.57 
 
 
359 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000100251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3137  spore germination protein A2  22.78 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3166  spore germination protein A2  22.3 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2852  spore germination protein; amino acid permease  21.94 
 
 
363 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000387723  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0156  spore germination protein xb  23.51 
 
 
355 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2102  spore germination protein A2  24.07 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2903  spore germination protein  22.66 
 
 
363 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161423  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3333  spore germination protein; amino acid permease  23.3 
 
 
365 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0135  spore germination protein KB  20.82 
 
 
363 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0786336  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1633  spore germination protein  24.27 
 
 
365 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0074  hypothetical protein  20.77 
 
 
365 aa  43.9  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2340  spore germination protein  22.45 
 
 
367 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00328418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4870  spore germination protein GerHB  21.39 
 
 
366 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4875  spore germination protein GerHB  20.89 
 
 
366 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>