65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0670 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0670  spore germination protein  100 
 
 		 365 aa  717    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0668  spore germination protein  44.26 
 
 		 369 aa  320  3e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0522  Spore germination protein  34.99 
 
 		 367 aa  229  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.234591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1970  spore germination protein  27.64 
 
 		 370 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2954  spore germination protein  28.74 
 
 		 364 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1937  spore germination protein  26.33 
 
 		 363 aa  122  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1733  spore germination protein  25.28 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0363147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0439  spore germination protein  23.74 
 
 		 374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2279  spore germination protein  26.92 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1192  hypothetical protein  25.27 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2166  spore germination protein  25.07 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.444413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1012  spore germination protein  26.3 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000935312 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0296  spore germination protein  24.59 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0055  spore germination protein  25.47 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3656  spore germination protein  22.34 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1955  spore germination protein  24.39 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.226978  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0136  spore germination protein  22.04 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00122585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0604  spore germination protein  22.94 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2102  spore germination protein A2  24.34 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3011  spore germination protein  24.26 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0663  spore germination protein B  24.37 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2041  spore germination protein  22.22 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0675  spore germination protein  23.1 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3283  spore germination protein  22.04 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764242  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3166  spore germination protein A2  24.34 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2852  spore germination protein; amino acid permease  24.05 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000387723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3137  spore germination protein A2  24.05 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0832  spore germination protein GerYB  23.81 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.11818e-54 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2466  spore germination protein  22.52 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0675  GerB family spore germination protein  23.81 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0074  hypothetical protein  27.44 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0603  spore germination protein  19.23 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0873  spore germination protein  23.78 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0781  spore germination protein  22.68 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2766  spore germination protein  23.29 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000369492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2903  spore germination protein  25.32 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3159  spore germination protein A2  24.34 
 
 		 363 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165697 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0817  spore germination protein, GerB family  22.41 
 
 		 369 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3655  spore germination protein  20.95 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4517  GerAB  23.45 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0243006 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0844  spore germination protein  23.49 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0744  spore germination protein GerLB  24.14 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0764  spore germination protein GerLB  23.9 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000950494 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0620  spore germination protein (amino acid permease)  24.16 
 
 		 374 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0246676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1460  spore germination protein  21.71 
 
 		 363 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0676  spore germination protein GerLB  23.9 
 
 		 374 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0598  spore germination protein  22.32 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0710  spore germination protein GerLB  23.28 
 
 		 343 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0924  spore germination protein, GerB family  21.75 
 
 		 369 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0802  spore germination protein  21.36 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0620  spore germination protein (amino acid permease)  23.9 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0779  spore germination protein GerLB  23.64 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.56621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0838  spore germination protein GerLB  24.15 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4593  spore germination protein GerLB  23.87 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0625  spore germination protein  22.81 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0135  spore germination protein KB  19.16 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0786336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0725  spore germination protein  24.73 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2565  spore germination protein  26.02 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.760269 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0079  hypothetical protein  24.32 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3200  hypothetical membrane protein  25.09 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2927  spore germination protein  26.92 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495537  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0156  spore germination protein xb  23.21 
 
 		 355 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0826  spore germination protein  22 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.724874  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1561  spore germination protein  24.07 
 
 		 368 aa  43.1  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.636005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0664  spore germination protein  26.52 
 
 		 363 aa  42.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>