84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1970 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1970  spore germination protein  100 
 
 
370 aa  726    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0668  spore germination protein  32.31 
 
 
369 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0439  spore germination protein  26.99 
 
 
374 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1733  spore germination protein  29.63 
 
 
369 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0363147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2954  spore germination protein  28.57 
 
 
364 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0670  spore germination protein  27.64 
 
 
365 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1937  spore germination protein  27.3 
 
 
363 aa  123  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0522  Spore germination protein  27.76 
 
 
367 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.234591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2279  spore germination protein  24.73 
 
 
361 aa  93.2  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2041  spore germination protein  28.68 
 
 
365 aa  86.7  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3656  spore germination protein  21.18 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3011  spore germination protein  26.77 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0603  spore germination protein  22.01 
 
 
363 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3655  spore germination protein  22.51 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2166  spore germination protein  21.98 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.444413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1012  spore germination protein  22.28 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000935312 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0135  spore germination protein KB  20.14 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0786336  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0136  spore germination protein  20.56 
 
 
365 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00122585  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0058  spore germination protein  27.2 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.962325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0781  spore germination protein  22.25 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173787  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0663  spore germination protein B  23.83 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0832  spore germination protein GerYB  23.47 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.11818e-54 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0675  GerB family spore germination protein  23.1 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0670  spore germination protein GerKB  25.64 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2903  spore germination protein  23.95 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0924  spore germination protein, GerB family  22.67 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0545  spore germination protein KB  25.36 
 
 
368 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0802  spore germination protein  22.15 
 
 
369 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0690  spore germination protein GerKB  25.36 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0601  spore germination protein GerKB  25.36 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2466  spore germination protein  20.28 
 
 
367 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0545  spore germination protein  25.36 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0634  spore germination protein GerKB  25.36 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0817  spore germination protein, GerB family  23.28 
 
 
369 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0079  hypothetical protein  24.15 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3159  spore germination protein A2  23.79 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165697 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2766  spore germination protein  21.94 
 
 
368 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000369492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0547  spore germination protein  25.64 
 
 
368 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3283  spore germination protein  21.48 
 
 
368 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764242  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3137  spore germination protein A2  24.35 
 
 
363 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0675  spore germination protein  23.85 
 
 
369 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3166  spore germination protein A2  24.19 
 
 
363 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2711  spore germination protein  23.12 
 
 
356 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2852  spore germination protein; amino acid permease  24.19 
 
 
363 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000387723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1192  hypothetical protein  24.61 
 
 
366 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4517  GerAB  23.56 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0243006 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2102  spore germination protein A2  24.36 
 
 
363 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0074  hypothetical protein  26.57 
 
 
365 aa  61.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0844  spore germination protein  22.94 
 
 
364 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4667  spore germination protein GerKB  24.2 
 
 
368 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00110  spore germination protein  25.14 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1011  spore germination protein  22.46 
 
 
361 aa  56.6  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1460  spore germination protein  23.4 
 
 
363 aa  56.6  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2665  spore germination protein  26.07 
 
 
377 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0296  spore germination protein  21.59 
 
 
385 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1955  spore germination protein  20.06 
 
 
368 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.226978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2927  spore germination protein  23.56 
 
 
306 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2565  spore germination protein  23.82 
 
 
357 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.760269 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0873  spore germination protein  21.71 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2664  spore germination protein  32.94 
 
 
362 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0826  spore germination protein  22.89 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.724874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3120  spore germination protein QB  21.83 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0055  spore germination protein  21.7 
 
 
369 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0702  spore germination protein GerKB  23.98 
 
 
369 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0641  spore germination protein  23.08 
 
 
366 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0604  spore germination protein  22.07 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0725  spore germination protein  24 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1633  spore germination protein  25.86 
 
 
365 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2457  spore germination protein  22.15 
 
 
359 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5574  spore germination protein  21.48 
 
 
367 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.300189 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0652  spore germination protein  23.88 
 
 
361 aa  47.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0224  spore germination protein XB  18.37 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000100251 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2340  spore germination protein  21.71 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00328418  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3409  spore germination protein  19.86 
 
 
364 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3634  spore germination protein  25.86 
 
 
365 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3370  spore germination protein  25.86 
 
 
365 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2435  spore germination protein  20.57 
 
 
365 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3200  hypothetical membrane protein  22.9 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0764  spore germination protein KB  28.57 
 
 
158 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3283  spore germination protein; amino acid permease  25.86 
 
 
365 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.946646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3583  spore germination protein  25.86 
 
 
365 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0051  spore germination protein  21.69 
 
 
359 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0312  TrkH family potassium uptake protein  38.03 
 
 
574 aa  43.1  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00568204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0598  spore germination protein  24.83 
 
 
371 aa  43.1  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>