92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1192 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1192  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  724    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0844  spore germination protein  37.12 
 
 
364 aa  225  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3011  spore germination protein  32.95 
 
 
368 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1460  spore germination protein  36.11 
 
 
363 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2166  spore germination protein  29.4 
 
 
370 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.444413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2466  spore germination protein  32.14 
 
 
367 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0135  spore germination protein KB  28.57 
 
 
363 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0786336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3655  spore germination protein  28.29 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2565  spore germination protein  27.93 
 
 
357 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.760269 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3656  spore germination protein  27.7 
 
 
365 aa  142  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0051  spore germination protein  28.57 
 
 
359 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2837  hypothetical protein  40 
 
 
182 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260649  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0136  spore germination protein  27.25 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00122585  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3365  spore germination protein  29.53 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000593195  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2041  spore germination protein  31.27 
 
 
365 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0781  spore germination protein  27.61 
 
 
360 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173787  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2279  spore germination protein  24.78 
 
 
361 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0652  spore germination protein  24.7 
 
 
361 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0603  spore germination protein  26.43 
 
 
363 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0296  spore germination protein  23.78 
 
 
385 aa  102  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1955  spore germination protein  24.66 
 
 
368 aa  99  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.226978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2711  spore germination protein  22.5 
 
 
356 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0074  hypothetical protein  26.76 
 
 
365 aa  97.4  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0055  spore germination protein  23.8 
 
 
369 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0802  spore germination protein  22.76 
 
 
369 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0670  spore germination protein  25.27 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3200  hypothetical membrane protein  26.43 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1011  spore germination protein  24.73 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2102  spore germination protein A2  23.28 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3166  spore germination protein A2  23.01 
 
 
363 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3137  spore germination protein A2  22.99 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2852  spore germination protein; amino acid permease  22.71 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000387723  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3283  spore germination protein  24.07 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764242  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3159  spore germination protein A2  22.42 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165697 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2903  spore germination protein  22.42 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1733  spore germination protein  25.36 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0363147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1561  spore germination protein  27.24 
 
 
368 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.636005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2665  spore germination protein  25.53 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0873  spore germination protein  26.63 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00110  spore germination protein  24.62 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0058  spore germination protein  22.7 
 
 
370 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.962325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0079  hypothetical protein  21.45 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1012  spore germination protein  26.2 
 
 
359 aa  64.3  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000935312 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1970  spore germination protein  24.61 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2766  spore germination protein  23.26 
 
 
368 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000369492  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2457  spore germination protein  24.4 
 
 
359 aa  60.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2435  spore germination protein  23.67 
 
 
365 aa  60.1  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0522  Spore germination protein  23.57 
 
 
367 aa  60.1  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.234591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0391  spore germination protein GerHB  25.69 
 
 
364 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2927  spore germination protein  20.6 
 
 
306 aa  59.3  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4484  spore germination protein IB  22.47 
 
 
366 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0604  spore germination protein  23.83 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1937  spore germination protein  22.89 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2664  spore germination protein  29.08 
 
 
362 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0439  spore germination protein  20 
 
 
374 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4465  spore germination protein IB  24.68 
 
 
366 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2954  spore germination protein  22.64 
 
 
364 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4870  spore germination protein GerHB  21.14 
 
 
366 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0675  GerB family spore germination protein  31.53 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4845  spore germination protein GerHB  24.45 
 
 
364 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4985  spore germination protein GerHB  25.33 
 
 
364 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4631  spore germination protein GerHB  25.33 
 
 
364 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0668  spore germination protein  22.7 
 
 
369 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4853  spore germination protein GerHB  25.33 
 
 
364 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4875  spore germination protein GerHB  21.41 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3409  spore germination protein  22.91 
 
 
364 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2459  spore germination protein  21.28 
 
 
364 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2340  spore germination protein  25.22 
 
 
367 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00328418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0832  spore germination protein GerYB  31.03 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.11818e-54 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3073  spore germination protein  22.67 
 
 
366 aa  50.4  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4564  spore germination protein  23.74 
 
 
364 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5574  spore germination protein  27.51 
 
 
367 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.300189 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0663  spore germination protein B  30.05 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0702  spore germination protein GerKB  23.21 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0156  spore germination protein xb  21.66 
 
 
355 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3634  spore germination protein  26.07 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3370  spore germination protein  26.07 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0826  spore germination protein  25 
 
 
369 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.724874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3283  spore germination protein; amino acid permease  27.78 
 
 
365 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.946646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0675  spore germination protein  26.25 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0924  spore germination protein, GerB family  24.3 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0817  spore germination protein, GerB family  24.3 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3583  spore germination protein  27.78 
 
 
365 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0224  spore germination protein XB  22.03 
 
 
359 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000100251 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3600  spore germination protein  26.43 
 
 
365 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1708  GerZB  23.01 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000089692 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4517  GerAB  24.6 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0243006 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4667  spore germination protein GerKB  22.78 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1769  spore germination protein  23.6 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3591  spore germination protein  27.19 
 
 
365 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3333  spore germination protein; amino acid permease  27.08 
 
 
365 aa  43.5  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3683  spore germination protein  25.55 
 
 
365 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>