48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0652 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0652  spore germination protein  100 
 
 
361 aa  701    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0135  spore germination protein KB  25.54 
 
 
363 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0786336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1192  hypothetical protein  24.7 
 
 
366 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3011  spore germination protein  25.14 
 
 
368 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3655  spore germination protein  26.47 
 
 
364 aa  103  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0844  spore germination protein  27.76 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1955  spore germination protein  25.87 
 
 
368 aa  86.3  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.226978  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1460  spore germination protein  21.7 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3365  spore germination protein  25.4 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000593195  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0802  spore germination protein  26.29 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2466  spore germination protein  24.73 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2565  spore germination protein  27.48 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.760269 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2166  spore germination protein  22.22 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.444413  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1011  spore germination protein  27.86 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2279  spore germination protein  23.8 
 
 
361 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3656  spore germination protein  21.26 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2435  spore germination protein  29.61 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0136  spore germination protein  22.6 
 
 
365 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00122585  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0296  spore germination protein  20.13 
 
 
385 aa  59.7  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2041  spore germination protein  23.62 
 
 
365 aa  59.7  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0051  spore germination protein  25.72 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1733  spore germination protein  23.43 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0363147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2711  spore germination protein  21.99 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2954  spore germination protein  22.22 
 
 
364 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0079  hypothetical protein  22.67 
 
 
374 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3283  spore germination protein  24.22 
 
 
368 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764242  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5574  spore germination protein  26.49 
 
 
367 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.300189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0604  spore germination protein  25.73 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1561  spore germination protein  23.83 
 
 
368 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.636005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2664  spore germination protein  31.36 
 
 
362 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2766  spore germination protein  24.24 
 
 
368 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000369492  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0781  spore germination protein  23.94 
 
 
360 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173787  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3200  hypothetical membrane protein  25.14 
 
 
366 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2665  spore germination protein  28.1 
 
 
377 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2063  spore germination protein  31.58 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.722464  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00110  spore germination protein  28.57 
 
 
365 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0055  spore germination protein  23.65 
 
 
369 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1970  spore germination protein  23.88 
 
 
370 aa  47.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0664  spore germination protein  23.31 
 
 
363 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2852  spore germination protein; amino acid permease  23.47 
 
 
363 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000387723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2459  spore germination protein  26.97 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0439  spore germination protein  21.01 
 
 
374 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2457  spore germination protein  25.45 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3166  spore germination protein A2  23 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2837  hypothetical protein  28.28 
 
 
182 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2754  spore germination protein XB  29.33 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0830054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3137  spore germination protein A2  23 
 
 
363 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2102  spore germination protein A2  24.73 
 
 
363 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>