30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2837 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2837  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  359  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260649  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1192  hypothetical protein  40 
 
 
366 aa  137  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0844  spore germination protein  42.6 
 
 
364 aa  127  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2466  spore germination protein  30.54 
 
 
367 aa  90.9  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0135  spore germination protein KB  30.59 
 
 
363 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0786336  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3011  spore germination protein  32.5 
 
 
368 aa  88.6  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3655  spore germination protein  27.06 
 
 
364 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1460  spore germination protein  28.93 
 
 
363 aa  75.9  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2565  spore germination protein  28.57 
 
 
357 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.760269 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1011  spore germination protein  32.24 
 
 
361 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2279  spore germination protein  22.5 
 
 
361 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0296  spore germination protein  25.45 
 
 
385 aa  55.1  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0603  spore germination protein  26.51 
 
 
363 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3656  spore germination protein  28.22 
 
 
365 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2166  spore germination protein  28.48 
 
 
370 aa  52  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.444413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0051  spore germination protein  27.33 
 
 
359 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0781  spore germination protein  31.2 
 
 
360 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173787  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2041  spore germination protein  29.88 
 
 
365 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0055  spore germination protein  28.4 
 
 
369 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0074  hypothetical protein  26.83 
 
 
365 aa  48.9  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0136  spore germination protein  24.69 
 
 
365 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00122585  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0652  spore germination protein  28.28 
 
 
361 aa  45.1  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2102  spore germination protein A2  27.78 
 
 
363 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3166  spore germination protein A2  27.78 
 
 
363 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3137  spore germination protein A2  27.78 
 
 
363 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3159  spore germination protein A2  27.78 
 
 
363 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165697 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2903  spore germination protein  28.4 
 
 
363 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161423  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2852  spore germination protein; amino acid permease  27.78 
 
 
363 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000387723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2711  spore germination protein  27.52 
 
 
356 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4564  spore germination protein  26.14 
 
 
364 aa  41.2  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>