35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2459 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2459  spore germination protein  100 
 
 
364 aa  732    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0156  spore germination protein xb  39.71 
 
 
355 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2754  spore germination protein XB  39.83 
 
 
363 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0830054  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0224  spore germination protein XB  37.32 
 
 
359 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000100251 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2041  spore germination protein  29.3 
 
 
365 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3283  spore germination protein  23.13 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0802  spore germination protein  21.6 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2279  spore germination protein  28.36 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3200  hypothetical membrane protein  23.29 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0296  spore germination protein  27.78 
 
 
385 aa  63.5  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3656  spore germination protein  22.73 
 
 
365 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0136  spore germination protein  22.76 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00122585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2766  spore germination protein  23.37 
 
 
368 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000369492  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2435  spore germination protein  26.37 
 
 
365 aa  57.4  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0135  spore germination protein KB  22.94 
 
 
363 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0786336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1192  hypothetical protein  22.22 
 
 
366 aa  57.4  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3011  spore germination protein  21.54 
 
 
368 aa  56.6  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3655  spore germination protein  22.75 
 
 
364 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2711  spore germination protein  22.13 
 
 
356 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2166  spore germination protein  23.4 
 
 
370 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.444413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2466  spore germination protein  24.14 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0844  spore germination protein  22.92 
 
 
364 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0652  spore germination protein  26.97 
 
 
361 aa  50.4  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1011  spore germination protein  22.14 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0058  spore germination protein  20.31 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.962325  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0439  spore germination protein  20.49 
 
 
374 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0079  hypothetical protein  22.31 
 
 
374 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0603  spore germination protein  26.01 
 
 
363 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1561  spore germination protein  25 
 
 
368 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.636005  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0781  spore germination protein  23.26 
 
 
360 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173787  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0055  spore germination protein  25.87 
 
 
369 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3137  spore germination protein A2  28.87 
 
 
363 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2102  spore germination protein A2  28.87 
 
 
363 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2852  spore germination protein; amino acid permease  28.87 
 
 
363 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000387723  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3166  spore germination protein A2  28.87 
 
 
363 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>