42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1165 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1165  dipicolinate synthase subunit A  100 
 
 		 300 aa  610  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00398415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2058  dipicolinate synthase subunit A  87.96 
 
 		 301 aa  542  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3840  dipicolinate synthase subunit A  71.48 
 
 		 300 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3850  dipicolinate synthase subunit A  71.48 
 
 		 300 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3814  dipicolinate synthase subunit A  71.14 
 
 		 300 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.15193e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3939  dipicolinate synthase subunit A  71.14 
 
 		 300 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.385927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3544  dipicolinate synthase subunit A  71.14 
 
 		 300 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3654  dipicolinate synthase subunit A  71.14 
 
 		 300 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3562  dipicolinate synthase subunit A  70.81 
 
 		 300 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1343  dipicolinate synthase subunit A  72.51 
 
 		 300 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3901  dipicolinate synthase subunit A  72.51 
 
 		 300 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00675499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3625  dipicolinate synthase subunit A  71.48 
 
 		 300 aa  441  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2455  dipicolinate synthase subunit A  70.47 
 
 		 300 aa  443  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1446  dipicolinic acid synthetase, A subunit  46.05 
 
 		 302 aa  264  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.527023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3168  dipicolinate synthase subunit A  40.21 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1943  dipicolinate synthase subunit A  38.13 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3662  dipicolinate synthase subunit A  39.33 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189177  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1456  dipicolinate synthase subunit A  39.58 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.1375  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1272  dipicolinate synthase subunit A  37.12 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00345659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1064  dipicolinate synthase subunit A  37.76 
 
 		 297 aa  195  9e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.189136  hitchhiker  0.00191942 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0348  dipicolinic acid synthetase, A subunit  37.24 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0943  dipicolinate synthase subunit A  36.15 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08650  dipicolinate synthase subunit A  36.17 
 
 		 321 aa  178  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.866181  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0978  dipicolinate synthase subunit A  33.67 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.953632  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0420  dipicolinate synthase subunit A  31.43 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1705  dipicolinate synthase subunit A  31.62 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00515237  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1249  dipicolinate synthase subunit A  31.47 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6049  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.33 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.289518  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3506  hypothetical protein  32.71 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.151747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2299  hypothetical protein  27.43 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06500  phosphoglycerate dehydrogenase-like oxidoreductase  31.96 
 
 		 313 aa  49.3  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.33 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1259  Alanine dehydrogenase  29.03 
 
 		 405 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2637  hypothetical protein  26.67 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0346  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  28.31 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1719  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.71 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1533  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.71 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.712764  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5627  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  27.52 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7152  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  29.79 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484236  normal  0.0114413 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0343  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.082465  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5815  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.67 
 
 		 248 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1641  ketol-acid reductoisomerase  39.47 
 
 		 335 aa  42.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.75245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>