32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0420 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0420  dipicolinate synthase subunit A  100 
 
 		 290 aa  586  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1705  dipicolinate synthase subunit A  70.69 
 
 		 291 aa  431  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00515237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0978  dipicolinate synthase subunit A  42.86 
 
 		 292 aa  248  7e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.953632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0348  dipicolinic acid synthetase, A subunit  38.71 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1272  dipicolinate synthase subunit A  35.66 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00345659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3168  dipicolinate synthase subunit A  35.76 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1446  dipicolinic acid synthetase, A subunit  35.4 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.527023  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1943  dipicolinate synthase subunit A  33.33 
 
 		 300 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388369  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1249  dipicolinate synthase subunit A  34.16 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1064  dipicolinate synthase subunit A  36.27 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.189136  hitchhiker  0.00191942 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0943  dipicolinate synthase subunit A  33.81 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3662  dipicolinate synthase subunit A  36.04 
 
 		 303 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08650  dipicolinate synthase subunit A  34.63 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.866181  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3625  dipicolinate synthase subunit A  32.27 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1165  dipicolinate synthase subunit A  31.43 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00398415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2455  dipicolinate synthase subunit A  30.85 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3544  dipicolinate synthase subunit A  31.34 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3840  dipicolinate synthase subunit A  31.34 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3901  dipicolinate synthase subunit A  31.56 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00675499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1343  dipicolinate synthase subunit A  31.56 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3562  dipicolinate synthase subunit A  31.34 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3850  dipicolinate synthase subunit A  31.34 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3814  dipicolinate synthase subunit A  31.34 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.15193e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3939  dipicolinate synthase subunit A  31.34 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.385927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3654  dipicolinate synthase subunit A  31.34 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2058  dipicolinate synthase subunit A  31.34 
 
 		 301 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1456  dipicolinate synthase subunit A  30.53 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.1375  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6049  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.47 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.289518  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2299  hypothetical protein  23.89 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3506  hypothetical protein  21.35 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.151747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3323  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  33.06 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2637  hypothetical protein  26.32 
 
 		 206 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>