21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2637 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2637  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2299  hypothetical protein  65.79 
 
 		 307 aa  254  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3506  hypothetical protein  52.56 
 
 		 287 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.151747 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6049  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.73 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.289518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1705  dipicolinate synthase subunit A  30.48 
 
 		 291 aa  52  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00515237  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2058  dipicolinate synthase subunit A  28.18 
 
 		 301 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1165  dipicolinate synthase subunit A  26.61 
 
 		 300 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00398415  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3625  dipicolinate synthase subunit A  25.69 
 
 		 300 aa  45.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3901  dipicolinate synthase subunit A  25.69 
 
 		 300 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00675499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1343  dipicolinate synthase subunit A  25.69 
 
 		 300 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0420  dipicolinate synthase subunit A  25.71 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2455  dipicolinate synthase subunit A  23.85 
 
 		 300 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3939  dipicolinate synthase subunit A  23.85 
 
 		 300 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.385927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3814  dipicolinate synthase subunit A  23.85 
 
 		 300 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.15193e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3654  dipicolinate synthase subunit A  23.85 
 
 		 300 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3840  dipicolinate synthase subunit A  24.77 
 
 		 300 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3562  dipicolinate synthase subunit A  23.85 
 
 		 300 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3544  dipicolinate synthase subunit A  23.85 
 
 		 300 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1446  dipicolinic acid synthetase, A subunit  27.52 
 
 		 302 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.527023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3850  dipicolinate synthase subunit A  23.85 
 
 		 300 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0978  dipicolinate synthase subunit A  28 
 
 		 292 aa  42  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.953632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>