25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2299 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2299  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2637  hypothetical protein  63.86 
 
 		 206 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3506  hypothetical protein  45.45 
 
 		 287 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.151747 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6049  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  35.19 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.289518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1705  dipicolinate synthase subunit A  29.73 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00515237  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1446  dipicolinic acid synthetase, A subunit  30.83 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.527023  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2058  dipicolinate synthase subunit A  28.45 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1943  dipicolinate synthase subunit A  28.1 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388369  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08650  dipicolinate synthase subunit A  34.62 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.866181  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0978  dipicolinate synthase subunit A  27.43 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.953632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1165  dipicolinate synthase subunit A  27.43 
 
 		 300 aa  49.3  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00398415  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0420  dipicolinate synthase subunit A  23.89 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2455  dipicolinate synthase subunit A  32.86 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3901  dipicolinate synthase subunit A  30 
 
 		 300 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00675499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1343  dipicolinate synthase subunit A  30 
 
 		 300 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1064  dipicolinate synthase subunit A  33.33 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.189136  hitchhiker  0.00191942 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3840  dipicolinate synthase subunit A  28.57 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3625  dipicolinate synthase subunit A  28.57 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3562  dipicolinate synthase subunit A  27.14 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3814  dipicolinate synthase subunit A  27.14 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.15193e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3939  dipicolinate synthase subunit A  27.14 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.385927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3654  dipicolinate synthase subunit A  27.14 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3850  dipicolinate synthase subunit A  27.14 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3544  dipicolinate synthase subunit A  27.14 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3168  dipicolinate synthase subunit A  27.78 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>