34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1705 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1705  dipicolinate synthase subunit A  100 
 
 
291 aa  591  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00515237  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0420  dipicolinate synthase subunit A  70.69 
 
 
290 aa  431  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0978  dipicolinate synthase subunit A  45.33 
 
 
292 aa  249  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.953632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0348  dipicolinic acid synthetase, A subunit  37.46 
 
 
298 aa  192  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1446  dipicolinic acid synthetase, A subunit  37.63 
 
 
302 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.527023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08650  dipicolinate synthase subunit A  35.92 
 
 
321 aa  186  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.866181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1064  dipicolinate synthase subunit A  37.54 
 
 
297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.189136  hitchhiker  0.00191942 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3168  dipicolinate synthase subunit A  36.82 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344441  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1272  dipicolinate synthase subunit A  37.41 
 
 
304 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00345659  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1249  dipicolinate synthase subunit A  34.53 
 
 
294 aa  176  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0943  dipicolinate synthase subunit A  34.95 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1943  dipicolinate synthase subunit A  33.22 
 
 
300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3662  dipicolinate synthase subunit A  36.76 
 
 
303 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2058  dipicolinate synthase subunit A  32.98 
 
 
301 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1165  dipicolinate synthase subunit A  31.62 
 
 
300 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00398415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2455  dipicolinate synthase subunit A  33.33 
 
 
300 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3625  dipicolinate synthase subunit A  33.7 
 
 
300 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3840  dipicolinate synthase subunit A  31.47 
 
 
300 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3901  dipicolinate synthase subunit A  32.23 
 
 
300 aa  148  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00675499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1343  dipicolinate synthase subunit A  32.23 
 
 
300 aa  148  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1456  dipicolinate synthase subunit A  32.09 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.1375  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3562  dipicolinate synthase subunit A  30.77 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3544  dipicolinate synthase subunit A  30.77 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3654  dipicolinate synthase subunit A  30.77 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3814  dipicolinate synthase subunit A  30.77 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.15193e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3850  dipicolinate synthase subunit A  30.77 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3939  dipicolinate synthase subunit A  30.77 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.385927  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6049  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.88 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.289518  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2299  hypothetical protein  29.73 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3506  hypothetical protein  24.55 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.151747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2637  hypothetical protein  31.58 
 
 
206 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1411  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  32.32 
 
 
319 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3483  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  26.8 
 
 
318 aa  42.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2688  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  30 
 
 
332 aa  42.7  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>