36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6049 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6049  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  100 
 
 		 296 aa  588  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.289518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1272  dipicolinate synthase subunit A  32.72 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00345659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1943  dipicolinate synthase subunit A  32.29 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0420  dipicolinate synthase subunit A  28.47 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3168  dipicolinate synthase subunit A  31.99 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08650  dipicolinate synthase subunit A  30.88 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.866181  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1705  dipicolinate synthase subunit A  30.88 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00515237  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0348  dipicolinic acid synthetase, A subunit  33.58 
 
 		 298 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1064  dipicolinate synthase subunit A  32.72 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.189136  hitchhiker  0.00191942 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1165  dipicolinate synthase subunit A  28.33 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00398415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3662  dipicolinate synthase subunit A  30.88 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0943  dipicolinate synthase subunit A  31.21 
 
 		 310 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1446  dipicolinic acid synthetase, A subunit  27.82 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.527023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3544  dipicolinate synthase subunit A  26.95 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3814  dipicolinate synthase subunit A  26.95 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.15193e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3840  dipicolinate synthase subunit A  26.95 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3654  dipicolinate synthase subunit A  26.95 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3939  dipicolinate synthase subunit A  26.95 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.385927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2455  dipicolinate synthase subunit A  27.3 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0978  dipicolinate synthase subunit A  27.7 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.953632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3901  dipicolinate synthase subunit A  26.95 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00675499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1343  dipicolinate synthase subunit A  26.95 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3850  dipicolinate synthase subunit A  26.95 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3562  dipicolinate synthase subunit A  26.95 
 
 		 300 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3625  dipicolinate synthase subunit A  27.3 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2058  dipicolinate synthase subunit A  27.42 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1249  dipicolinate synthase subunit A  25.93 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1456  dipicolinate synthase subunit A  25.46 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.1375  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2299  hypothetical protein  35.19 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3506  hypothetical protein  32.71 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.151747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2637  hypothetical protein  34.07 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06500  phosphoglycerate dehydrogenase-like oxidoreductase  36.51 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1660  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  28.91 
 
 		 322 aa  49.3  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.653624  normal  0.0436541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  32.76 
 
 		 422 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  32.76 
 
 		 422 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4364  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding protein  34.65 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162861  normal  0.0719661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>