21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3506 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3506  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.151747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2299  hypothetical protein  49.21 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2637  hypothetical protein  52.56 
 
 		 206 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6049  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.71 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.289518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1165  dipicolinate synthase subunit A  32.71 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00398415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2058  dipicolinate synthase subunit A  31.78 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1705  dipicolinate synthase subunit A  24.55 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00515237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1343  dipicolinate synthase subunit A  27.78 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3901  dipicolinate synthase subunit A  27.78 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00675499  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2455  dipicolinate synthase subunit A  28.7 
 
 		 300 aa  52.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3840  dipicolinate synthase subunit A  26.85 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3625  dipicolinate synthase subunit A  25.93 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3544  dipicolinate synthase subunit A  25.93 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3814  dipicolinate synthase subunit A  25.93 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.15193e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3939  dipicolinate synthase subunit A  25.93 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.385927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3654  dipicolinate synthase subunit A  25.93 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1943  dipicolinate synthase subunit A  30.56 
 
 		 300 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388369  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3562  dipicolinate synthase subunit A  25.93 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3850  dipicolinate synthase subunit A  25.93 
 
 		 300 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0978  dipicolinate synthase subunit A  23.81 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.953632  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0420  dipicolinate synthase subunit A  21.35 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>