36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1943 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1943  dipicolinate synthase subunit A  100 
 
 		 300 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388369  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3168  dipicolinate synthase subunit A  54.7 
 
 		 303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3662  dipicolinate synthase subunit A  51.01 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189177  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1272  dipicolinate synthase subunit A  47.33 
 
 		 304 aa  278  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00345659  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0348  dipicolinic acid synthetase, A subunit  51.19 
 
 		 298 aa  268  8.999999999999999e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1064  dipicolinate synthase subunit A  47.26 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.189136  hitchhiker  0.00191942 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0943  dipicolinate synthase subunit A  44.76 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08650  dipicolinate synthase subunit A  40.93 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.866181  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1456  dipicolinate synthase subunit A  43.26 
 
 		 292 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.1375  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2058  dipicolinate synthase subunit A  40.54 
 
 		 301 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1165  dipicolinate synthase subunit A  38.13 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00398415  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1446  dipicolinic acid synthetase, A subunit  37.93 
 
 		 302 aa  215  9e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.527023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3840  dipicolinate synthase subunit A  38.13 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3544  dipicolinate synthase subunit A  37.79 
 
 		 300 aa  212  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3654  dipicolinate synthase subunit A  37.79 
 
 		 300 aa  211  9e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3814  dipicolinate synthase subunit A  37.79 
 
 		 300 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.15193e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3850  dipicolinate synthase subunit A  37.79 
 
 		 300 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3939  dipicolinate synthase subunit A  37.79 
 
 		 300 aa  211  9e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.385927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3562  dipicolinate synthase subunit A  37.79 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2455  dipicolinate synthase subunit A  38.14 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3625  dipicolinate synthase subunit A  39.02 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3901  dipicolinate synthase subunit A  38.62 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00675499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1343  dipicolinate synthase subunit A  38.62 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0420  dipicolinate synthase subunit A  33.33 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1705  dipicolinate synthase subunit A  33.22 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00515237  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1249  dipicolinate synthase subunit A  32.65 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0978  dipicolinate synthase subunit A  29.02 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.953632  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6049  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.29 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.289518  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2299  hypothetical protein  28.1 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3506  hypothetical protein  30.56 
 
 		 287 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.151747 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3401  adenosylhomocysteinase  25.96 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  26.83 
 
 		 426 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3483  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  31.33 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06500  phosphoglycerate dehydrogenase-like oxidoreductase  29.89 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.52 
 
 		 349 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.85 
 
 		 314 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>