37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3168 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3168  dipicolinate synthase subunit A  100 
 
 
303 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344441  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1943  dipicolinate synthase subunit A  54.7 
 
 
300 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388369  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0943  dipicolinate synthase subunit A  52.1 
 
 
310 aa  278  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3662  dipicolinate synthase subunit A  46.49 
 
 
303 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189177  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1272  dipicolinate synthase subunit A  45.42 
 
 
304 aa  262  6e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00345659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1064  dipicolinate synthase subunit A  49.66 
 
 
297 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.189136  hitchhiker  0.00191942 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0348  dipicolinic acid synthetase, A subunit  48.81 
 
 
298 aa  252  7e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2058  dipicolinate synthase subunit A  40.47 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1165  dipicolinate synthase subunit A  40.21 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00398415  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1446  dipicolinic acid synthetase, A subunit  41.03 
 
 
302 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.527023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08650  dipicolinate synthase subunit A  38.43 
 
 
321 aa  216  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.866181  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3840  dipicolinate synthase subunit A  37.88 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3544  dipicolinate synthase subunit A  37.54 
 
 
300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3850  dipicolinate synthase subunit A  37.54 
 
 
300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3939  dipicolinate synthase subunit A  37.54 
 
 
300 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.385927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3654  dipicolinate synthase subunit A  37.54 
 
 
300 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3814  dipicolinate synthase subunit A  37.54 
 
 
300 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.15193e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2455  dipicolinate synthase subunit A  37.88 
 
 
300 aa  211  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3562  dipicolinate synthase subunit A  37.54 
 
 
300 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1343  dipicolinate synthase subunit A  37.67 
 
 
300 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3901  dipicolinate synthase subunit A  37.67 
 
 
300 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00675499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3625  dipicolinate synthase subunit A  37.93 
 
 
300 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1456  dipicolinate synthase subunit A  37.68 
 
 
292 aa  196  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.1375  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0420  dipicolinate synthase subunit A  35.76 
 
 
290 aa  186  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1705  dipicolinate synthase subunit A  36.82 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00515237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0978  dipicolinate synthase subunit A  31.58 
 
 
292 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.953632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1249  dipicolinate synthase subunit A  31.58 
 
 
294 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6049  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.99 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.289518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  36 
 
 
307 aa  46.6  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09870  phosphoglycerate dehydrogenase-like oxidoreductase  29.7 
 
 
361 aa  44.3  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.236079  normal  0.0594741 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0273  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  28.97 
 
 
325 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.443724  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  29 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00628  D-lactate dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17040)  29.25 
 
 
359 aa  43.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130696  normal  0.745449 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47440  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  24.6 
 
 
310 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1357  adenosylhomocysteinase  27.05 
 
 
380 aa  42.7  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.361298  normal  0.0210902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2299  hypothetical protein  26.55 
 
 
307 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2346  putative dehydrogenase  29.31 
 
 
335 aa  42.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>