35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1272 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1272  dipicolinate synthase subunit A  100 
 
 		 304 aa  604  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00345659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1943  dipicolinate synthase subunit A  47.33 
 
 		 300 aa  278  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3662  dipicolinate synthase subunit A  44.85 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3168  dipicolinate synthase subunit A  45.42 
 
 		 303 aa  262  6e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08650  dipicolinate synthase subunit A  43.06 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.866181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1064  dipicolinate synthase subunit A  43.43 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.189136  hitchhiker  0.00191942 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0348  dipicolinic acid synthetase, A subunit  43.69 
 
 		 298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0943  dipicolinate synthase subunit A  40.21 
 
 		 310 aa  219  5e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1446  dipicolinic acid synthetase, A subunit  38.89 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.527023  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2058  dipicolinate synthase subunit A  38.59 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1165  dipicolinate synthase subunit A  37.12 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00398415  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1456  dipicolinate synthase subunit A  37.93 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.1375  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3625  dipicolinate synthase subunit A  36.77 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2455  dipicolinate synthase subunit A  35.23 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3544  dipicolinate synthase subunit A  34.9 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3654  dipicolinate synthase subunit A  34.9 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3939  dipicolinate synthase subunit A  34.9 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.385927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3814  dipicolinate synthase subunit A  34.9 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.15193e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3840  dipicolinate synthase subunit A  34.9 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3901  dipicolinate synthase subunit A  35.76 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00675499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1343  dipicolinate synthase subunit A  35.76 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3850  dipicolinate synthase subunit A  34.9 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3562  dipicolinate synthase subunit A  34.9 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0420  dipicolinate synthase subunit A  35.66 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1705  dipicolinate synthase subunit A  37.41 
 
 		 291 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00515237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0978  dipicolinate synthase subunit A  31.25 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.953632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1249  dipicolinate synthase subunit A  32 
 
 		 294 aa  153  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6049  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.72 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.289518  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06500  phosphoglycerate dehydrogenase-like oxidoreductase  33.04 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6845  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  33.67 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1274  Tetrapyrrole biosynthesis, glutamyl-tRNA reductase-like protein  22.22 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.826285  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3446  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  29.25 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3483  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  33.68 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0861  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.91 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1368  glutamyl-tRNA reductase  32.98 
 
 		 403 aa  42.4  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>