20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2533 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2533  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  825    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1997  hypothetical protein  31.52 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000131605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1999  hypothetical protein  31.09 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0631187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0609  hypothetical protein  30.65 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.985132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0617  hypothetical protein  29.31 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0616  hypothetical protein  29.22 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1150  hypothetical protein  27.83 
 
 		 402 aa  142  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0612  hypothetical protein  29.19 
 
 		 407 aa  142  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.636411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1956  hypothetical protein  28.85 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4506  hypothetical protein  27.71 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491916  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1108  hypothetical protein  29.88 
 
 		 384 aa  122  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4138  hypothetical protein  26.12 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.178739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0571  hypothetical protein  26.4 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3228  hypothetical protein  27.05 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3976  hypothetical protein  24.29 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0951  hypothetical protein  25.58 
 
 		 430 aa  99.8  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00169672  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0059  hypothetical protein  27.06 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00064  hypothetical protein  26.03 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1421  hypothetical protein  31.69 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2332  hypothetical protein  27.27 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>