36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1339 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1339  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.23161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0081  membrane protein-like protein  50 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1554  hypothetical protein  46.71 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3642  hypothetical protein  48.1 
 
 		 154 aa  156  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1096  hypothetical protein  51.54 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3166  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1400  membrane protein-like protein  44.23 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0546  membrane protein-like protein  41.18 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2883  membrane protein-like protein  42.31 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000154879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0068  hypothetical protein  42.07 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2064  hypothetical protein  42.38 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0915  membrane protein-like protein  45.76 
 
 		 191 aa  106  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2104  membrane protein-like protein  41.33 
 
 		 194 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119024  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1716  hypothetical protein  31.3 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0510625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1850  hypothetical protein  31.91 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0444862  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  28.32 
 
 		 417 aa  67.8  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2120  hypothetical protein  38.04 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1512  hypothetical protein  31.4 
 
 		 422 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.300863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2807  YHS  34.17 
 
 		 489 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3547  membrane protein-like protein  29.13 
 
 		 448 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0526  integral membrane protein  31.15 
 
 		 454 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0035517  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0162  hypothetical protein  29.13 
 
 		 423 aa  58.5  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.95694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2134  YHS domain-containing protein  32.48 
 
 		 469 aa  57.4  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2139  YHS domain-containing protein  32.48 
 
 		 469 aa  57.4  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2249  YHS domain-containing protein  32.48 
 
 		 469 aa  57.4  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1168  conserved hypothetical integral membrane protein (YHS domain protein)  32.73 
 
 		 473 aa  57  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.657748  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1651  hypothetical protein  31.9 
 
 		 467 aa  57  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1253  hypothetical protein  28.95 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.387075  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1832  hypothetical protein  31.9 
 
 		 467 aa  57  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2020  hypothetical protein  32.76 
 
 		 466 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.413086  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1387  YHS domain protein  33.33 
 
 		 466 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1785  hypothetical protein  33.33 
 
 		 465 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0448  integral membrane protein  30.77 
 
 		 476 aa  52.4  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.215453  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0765  hypothetical protein  28.97 
 
 		 459 aa  51.2  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0431  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA(glucose-inhibited division protein A)  29 
 
 		 455 aa  50.8  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00706476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1369  hypothetical protein  26.26 
 
 		 193 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000112601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>