30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1400 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1400  membrane protein-like protein  100 
 
 		 151 aa  306  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2883  membrane protein-like protein  89.4 
 
 		 151 aa  278  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000154879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0081  membrane protein-like protein  59.74 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3642  hypothetical protein  51.3 
 
 		 154 aa  160  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1554  hypothetical protein  48 
 
 		 177 aa  146  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0546  membrane protein-like protein  43.54 
 
 		 145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1339  hypothetical protein  45.6 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.23161  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1096  hypothetical protein  48.8 
 
 		 157 aa  123  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3166  hypothetical protein  48 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0068  hypothetical protein  43.41 
 
 		 152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2064  hypothetical protein  41.67 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2104  membrane protein-like protein  34.97 
 
 		 194 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0915  membrane protein-like protein  37.84 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1850  hypothetical protein  33.06 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0444862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2120  hypothetical protein  31.67 
 
 		 184 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1716  hypothetical protein  29.13 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0510625  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0431  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA(glucose-inhibited division protein A)  31 
 
 		 455 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00706476  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  28.95 
 
 		 417 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0765  hypothetical protein  28.32 
 
 		 459 aa  49.7  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2807  YHS  33.66 
 
 		 489 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3547  membrane protein-like protein  27.34 
 
 		 448 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1168  conserved hypothetical integral membrane protein (YHS domain protein)  29 
 
 		 473 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.657748  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2020  hypothetical protein  36.96 
 
 		 466 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.413086  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0448  integral membrane protein  28.07 
 
 		 476 aa  47.4  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.215453  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0526  integral membrane protein  25.83 
 
 		 454 aa  47  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0035517  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1832  hypothetical protein  35.87 
 
 		 467 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1651  hypothetical protein  35.87 
 
 		 467 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1253  hypothetical protein  25.41 
 
 		 425 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.387075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  26.53 
 
 		 348 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0162  hypothetical protein  25.62 
 
 		 423 aa  40.4  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.95694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>