35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0068 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0068  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  309  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2064  hypothetical protein  49.32 
 
 
153 aa  150  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0081  membrane protein-like protein  51.22 
 
 
154 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0546  membrane protein-like protein  45.39 
 
 
145 aa  137  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3642  hypothetical protein  45.58 
 
 
154 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1554  hypothetical protein  46.31 
 
 
177 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1096  hypothetical protein  47.76 
 
 
157 aa  121  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2104  membrane protein-like protein  48.82 
 
 
194 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119024  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1400  membrane protein-like protein  43.41 
 
 
151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3166  hypothetical protein  46.34 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2883  membrane protein-like protein  38.93 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000154879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1339  hypothetical protein  43.94 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.23161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0915  membrane protein-like protein  46.36 
 
 
191 aa  102  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2120  hypothetical protein  35.54 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  37.76 
 
 
417 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3547  membrane protein-like protein  40.86 
 
 
448 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1850  hypothetical protein  33.06 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0444862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2807  YHS  39.13 
 
 
489 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0162  hypothetical protein  31.67 
 
 
423 aa  64.7  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.95694 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0431  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA(glucose-inhibited division protein A)  34.78 
 
 
455 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00706476  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1716  hypothetical protein  36.71 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0510625  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1651  hypothetical protein  33.67 
 
 
467 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0526  integral membrane protein  33.98 
 
 
454 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0035517  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1832  hypothetical protein  33.67 
 
 
467 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0448  integral membrane protein  31.52 
 
 
476 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.215453  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1253  hypothetical protein  30.83 
 
 
425 aa  61.2  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.387075  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1387  YHS domain protein  34.45 
 
 
466 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1785  hypothetical protein  34.45 
 
 
465 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2020  hypothetical protein  35.71 
 
 
466 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.413086  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1512  hypothetical protein  30.43 
 
 
422 aa  60.8  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.300863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2134  YHS domain-containing protein  34.48 
 
 
469 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2249  YHS domain-containing protein  34.48 
 
 
469 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2139  YHS domain-containing protein  34.48 
 
 
469 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0765  hypothetical protein  30.43 
 
 
459 aa  57  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1168  conserved hypothetical integral membrane protein (YHS domain protein)  31.52 
 
 
473 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.657748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>