24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2120 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2120  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1850  hypothetical protein  48.15 
 
 
163 aa  153  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0444862  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1716  hypothetical protein  45.06 
 
 
159 aa  148  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0510625  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2064  hypothetical protein  32.3 
 
 
153 aa  92.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0068  hypothetical protein  31.48 
 
 
152 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2104  membrane protein-like protein  34.71 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0915  membrane protein-like protein  38.04 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0546  membrane protein-like protein  30.38 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1554  hypothetical protein  32.2 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3642  hypothetical protein  33.65 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0081  membrane protein-like protein  33.61 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1339  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.23161  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1096  hypothetical protein  32.2 
 
 
157 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3166  hypothetical protein  32.2 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2883  membrane protein-like protein  31.67 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000154879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1400  membrane protein-like protein  31.67 
 
 
151 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  34.44 
 
 
417 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2020  hypothetical protein  22.54 
 
 
466 aa  45.4  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.413086  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2807  YHS  28.3 
 
 
489 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1832  hypothetical protein  22.47 
 
 
467 aa  44.7  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1651  hypothetical protein  22.47 
 
 
467 aa  44.7  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1512  hypothetical protein  30.88 
 
 
422 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.300863  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0431  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA(glucose-inhibited division protein A)  32.89 
 
 
455 aa  42.4  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00706476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3547  membrane protein-like protein  21.29 
 
 
448 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>