20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1850 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1850  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  335  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0444862  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1716  hypothetical protein  54.14 
 
 		 159 aa  187  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0510625  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2120  hypothetical protein  58.33 
 
 		 184 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2064  hypothetical protein  36.36 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1554  hypothetical protein  32.28 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0915  membrane protein-like protein  28.48 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0546  membrane protein-like protein  36.89 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2104  membrane protein-like protein  36.14 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119024  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1400  membrane protein-like protein  33.06 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0068  hypothetical protein  32.8 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3642  hypothetical protein  29.63 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1339  hypothetical protein  36.56 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.23161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2883  membrane protein-like protein  34 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000154879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0081  membrane protein-like protein  31.62 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1096  hypothetical protein  32.48 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3166  hypothetical protein  31.62 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  37.04 
 
 		 417 aa  51.2  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1369  hypothetical protein  27.1 
 
 		 193 aa  48.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000112601  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1512  hypothetical protein  30 
 
 		 422 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.300863  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3547  membrane protein-like protein  26.61 
 
 		 448 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>