20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1716 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1716  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  326  7e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0510625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1850  hypothetical protein  55.7 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0444862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2120  hypothetical protein  52.5 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1554  hypothetical protein  31.88 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0915  membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2064  hypothetical protein  35 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2104  membrane protein-like protein  31.5 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119024  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3642  hypothetical protein  33.81 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3166  hypothetical protein  33.91 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1096  hypothetical protein  33.91 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0546  membrane protein-like protein  34.21 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0081  membrane protein-like protein  36.05 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1339  hypothetical protein  38.2 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.23161  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0068  hypothetical protein  36.71 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2883  membrane protein-like protein  31.45 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000154879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1400  membrane protein-like protein  29.13 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  33.71 
 
 		 417 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1512  hypothetical protein  32.65 
 
 		 422 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.300863  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3547  membrane protein-like protein  23.08 
 
 		 448 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0448  integral membrane protein  31.58 
 
 		 476 aa  40.4  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.215453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>