35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1096 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1096  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  317  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3166  hypothetical protein  91.08 
 
 		 157 aa  253  8e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1554  hypothetical protein  58.55 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3642  hypothetical protein  54.14 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0081  membrane protein-like protein  56.94 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1339  hypothetical protein  51.54 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.23161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0546  membrane protein-like protein  42.95 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0068  hypothetical protein  44.97 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2064  hypothetical protein  44.97 
 
 		 153 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1400  membrane protein-like protein  43.05 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2883  membrane protein-like protein  41.72 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000154879 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0915  membrane protein-like protein  47.32 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2104  membrane protein-like protein  36.05 
 
 		 194 aa  97.1  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  30.22 
 
 		 417 aa  77.8  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0526  integral membrane protein  33.33 
 
 		 454 aa  72  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0035517  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1716  hypothetical protein  33.91 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0510625  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2807  YHS  32.06 
 
 		 489 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2120  hypothetical protein  32.2 
 
 		 184 aa  67  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1512  hypothetical protein  28.86 
 
 		 422 aa  65.1  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.300863  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3547  membrane protein-like protein  29.58 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2134  YHS domain-containing protein  36.44 
 
 		 469 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2249  YHS domain-containing protein  36.44 
 
 		 469 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2139  YHS domain-containing protein  36.44 
 
 		 469 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1387  YHS domain protein  33.85 
 
 		 466 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1785  hypothetical protein  33.08 
 
 		 465 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1253  hypothetical protein  32.17 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.387075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1850  hypothetical protein  28.67 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0444862  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2020  hypothetical protein  32.48 
 
 		 466 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.413086  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0448  integral membrane protein  30.33 
 
 		 476 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.215453  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0765  hypothetical protein  28.38 
 
 		 459 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1651  hypothetical protein  32.48 
 
 		 467 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1832  hypothetical protein  32.48 
 
 		 467 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0162  hypothetical protein  30.43 
 
 		 423 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.95694 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0431  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA(glucose-inhibited division protein A)  26.52 
 
 		 455 aa  50.8  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00706476  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1168  conserved hypothetical integral membrane protein (YHS domain protein)  30.77 
 
 		 473 aa  48.5  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.657748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>