34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0081 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0081  membrane protein-like protein  100 
 
 		 154 aa  316  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3642  hypothetical protein  71.43 
 
 		 154 aa  239  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1400  membrane protein-like protein  59.74 
 
 		 151 aa  189  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2883  membrane protein-like protein  58.44 
 
 		 151 aa  183  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000154879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1554  hypothetical protein  53.74 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1096  hypothetical protein  58.52 
 
 		 157 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3166  hypothetical protein  59.68 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0546  membrane protein-like protein  48.23 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1339  hypothetical protein  53.08 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.23161  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0068  hypothetical protein  51.22 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2064  hypothetical protein  39.86 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0915  membrane protein-like protein  38.74 
 
 		 191 aa  95.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2104  membrane protein-like protein  35.48 
 
 		 194 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  30.71 
 
 		 417 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1512  hypothetical protein  29.8 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.300863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2120  hypothetical protein  33.61 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1716  hypothetical protein  36.05 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0510625  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1253  hypothetical protein  32.89 
 
 		 425 aa  65.1  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.387075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1850  hypothetical protein  31.62 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0444862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2807  YHS  34.19 
 
 		 489 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2134  YHS domain-containing protein  35 
 
 		 469 aa  60.5  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2249  YHS domain-containing protein  35 
 
 		 469 aa  60.5  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2139  YHS domain-containing protein  35 
 
 		 469 aa  60.5  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0526  integral membrane protein  31.37 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0035517  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2020  hypothetical protein  35.45 
 
 		 466 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.413086  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0431  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA(glucose-inhibited division protein A)  33 
 
 		 455 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00706476  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1832  hypothetical protein  35.45 
 
 		 467 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1651  hypothetical protein  35.45 
 
 		 467 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0162  hypothetical protein  33.07 
 
 		 423 aa  57  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.95694 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3547  membrane protein-like protein  32.26 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0448  integral membrane protein  30.77 
 
 		 476 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.215453  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0765  hypothetical protein  30.91 
 
 		 459 aa  52  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1168  conserved hypothetical integral membrane protein (YHS domain protein)  30.91 
 
 		 473 aa  50.8  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.657748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1369  hypothetical protein  25.4 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000112601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>