31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1253 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1253  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  865    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.387075  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0162  hypothetical protein  60.33 
 
 
423 aa  510  1e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.95694 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1512  hypothetical protein  32.82 
 
 
422 aa  202  6e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.300863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  26.83 
 
 
417 aa  112  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2020  hypothetical protein  41.8 
 
 
466 aa  101  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.413086  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1651  hypothetical protein  40.98 
 
 
467 aa  98.6  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1832  hypothetical protein  40.98 
 
 
467 aa  98.6  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2807  YHS  38.46 
 
 
489 aa  92.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1168  conserved hypothetical integral membrane protein (YHS domain protein)  42.71 
 
 
473 aa  90.5  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.657748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2134  YHS domain-containing protein  39.13 
 
 
469 aa  87.8  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1785  hypothetical protein  39.47 
 
 
465 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1387  YHS domain protein  36.49 
 
 
466 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2249  YHS domain-containing protein  39.13 
 
 
469 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2139  YHS domain-containing protein  39.13 
 
 
469 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0448  integral membrane protein  23.05 
 
 
476 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.215453  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0526  integral membrane protein  44.94 
 
 
454 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0035517  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0431  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA(glucose-inhibited division protein A)  32.58 
 
 
455 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00706476  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3642  hypothetical protein  32.94 
 
 
154 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0765  hypothetical protein  39.77 
 
 
459 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3547  membrane protein-like protein  37.18 
 
 
448 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0081  membrane protein-like protein  32.89 
 
 
154 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0068  hypothetical protein  30.83 
 
 
152 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1554  hypothetical protein  28 
 
 
177 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0915  membrane protein-like protein  28.57 
 
 
191 aa  60.1  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1096  hypothetical protein  32.77 
 
 
157 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2104  membrane protein-like protein  27.97 
 
 
194 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3166  hypothetical protein  35.4 
 
 
157 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1339  hypothetical protein  29.91 
 
 
158 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.23161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2064  hypothetical protein  24.5 
 
 
153 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0546  membrane protein-like protein  23.13 
 
 
145 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1400  membrane protein-like protein  25.41 
 
 
151 aa  43.5  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>