35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1785 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1785  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  945    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1387  YHS domain protein  92.92 
 
 		 466 aa  816    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2249  YHS domain-containing protein  63.66 
 
 		 469 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2134  YHS domain-containing protein  63.66 
 
 		 469 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2139  YHS domain-containing protein  63.66 
 
 		 469 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2807  YHS  41.08 
 
 		 489 aa  250  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1168  conserved hypothetical integral membrane protein (YHS domain protein)  28.26 
 
 		 473 aa  205  1e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.657748  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0526  integral membrane protein  32.13 
 
 		 454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0035517  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1651  hypothetical protein  34.25 
 
 		 467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0765  hypothetical protein  31.67 
 
 		 459 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0431  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA(glucose-inhibited division protein A)  31.3 
 
 		 455 aa  196  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00706476  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1832  hypothetical protein  33.9 
 
 		 467 aa  195  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0448  integral membrane protein  29.91 
 
 		 476 aa  192  9e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.215453  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2020  hypothetical protein  34.02 
 
 		 466 aa  189  8e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.413086  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1512  hypothetical protein  29.18 
 
 		 422 aa  97.1  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.300863  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1253  hypothetical protein  27.33 
 
 		 425 aa  96.3  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.387075  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0162  hypothetical protein  31.4 
 
 		 423 aa  93.2  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.95694 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3547  membrane protein-like protein  31.84 
 
 		 448 aa  88.2  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  31.68 
 
 		 417 aa  87  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0915  membrane protein-like protein  31.41 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1554  hypothetical protein  32.82 
 
 		 177 aa  67  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3642  hypothetical protein  35.83 
 
 		 154 aa  67  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0068  hypothetical protein  35.29 
 
 		 152 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3166  hypothetical protein  38.83 
 
 		 157 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1096  hypothetical protein  33.08 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2064  hypothetical protein  35.29 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2104  membrane protein-like protein  31.62 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119024  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1339  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.23161  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  41.07 
 
 		 804 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2883  membrane protein-like protein  31.67 
 
 		 151 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000154879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0546  membrane protein-like protein  30.89 
 
 		 145 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  39.66 
 
 		 793 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3871  heavy metal translocating P-type ATPase  33.9 
 
 		 908 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 		 973 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  38.6 
 
 		 1020 aa  43.1  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>