39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0448 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0448  integral membrane protein  100 
 
 		 476 aa  953    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.215453  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0526  integral membrane protein  47.92 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0035517  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0431  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA(glucose-inhibited division protein A)  41.18 
 
 		 455 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00706476  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0765  hypothetical protein  39.7 
 
 		 459 aa  327  3e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1168  conserved hypothetical integral membrane protein (YHS domain protein)  39.01 
 
 		 473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.657748  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1651  hypothetical protein  37.74 
 
 		 467 aa  273  6e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1832  hypothetical protein  37.96 
 
 		 467 aa  272  1e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2020  hypothetical protein  37.64 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.413086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2249  YHS domain-containing protein  36.43 
 
 		 469 aa  192  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2134  YHS domain-containing protein  36.43 
 
 		 469 aa  192  8e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2139  YHS domain-containing protein  36.43 
 
 		 469 aa  192  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1785  hypothetical protein  35.69 
 
 		 465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1387  YHS domain protein  29.22 
 
 		 466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2807  YHS  30.45 
 
 		 489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1512  hypothetical protein  27.55 
 
 		 422 aa  88.2  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.300863  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1253  hypothetical protein  23.05 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.387075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3547  membrane protein-like protein  35 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  25 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0162  hypothetical protein  41.05 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.95694 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0068  hypothetical protein  31.52 
 
 		 152 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3166  hypothetical protein  31.15 
 
 		 157 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1096  hypothetical protein  29.51 
 
 		 157 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2064  hypothetical protein  30.3 
 
 		 153 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0081  membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 154 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0546  membrane protein-like protein  30.3 
 
 		 145 aa  54.3  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1554  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3642  hypothetical protein  29.52 
 
 		 154 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1339  hypothetical protein  30.77 
 
 		 158 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.23161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0915  membrane protein-like protein  25.74 
 
 		 191 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2104  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 194 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2883  membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 151 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000154879 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3038  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 842 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0324  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 842 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2230  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 842 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0506  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 807 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0311  copper-translocating P-type ATPase  35 
 
 		 842 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2054  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 842 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860111  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1400  membrane protein-like protein  28.07 
 
 		 151 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0605  hypothetical protein  38.18 
 
 		 62 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>