32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0765 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0765  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  915    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0431  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA(glucose-inhibited division protein A)  72.55 
 
 
455 aa  676    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00706476  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0526  integral membrane protein  44.35 
 
 
454 aa  391  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0035517  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0448  integral membrane protein  39.7 
 
 
476 aa  327  3e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.215453  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1168  conserved hypothetical integral membrane protein (YHS domain protein)  38.46 
 
 
473 aa  301  1e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.657748  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1651  hypothetical protein  39.18 
 
 
467 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1832  hypothetical protein  38.96 
 
 
467 aa  276  6e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2020  hypothetical protein  37.88 
 
 
466 aa  261  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.413086  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2807  YHS  50.79 
 
 
489 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2249  YHS domain-containing protein  37.31 
 
 
469 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2134  YHS domain-containing protein  37.31 
 
 
469 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2139  YHS domain-containing protein  37.31 
 
 
469 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1785  hypothetical protein  38.57 
 
 
465 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1387  YHS domain protein  41.75 
 
 
466 aa  186  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1512  hypothetical protein  28.79 
 
 
422 aa  88.6  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.300863  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3547  membrane protein-like protein  34.86 
 
 
448 aa  77  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  29.19 
 
 
417 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1253  hypothetical protein  39.77 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.387075  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0162  hypothetical protein  37.8 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.95694 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1554  hypothetical protein  32.56 
 
 
177 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0915  membrane protein-like protein  27.63 
 
 
191 aa  63.9  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2064  hypothetical protein  31 
 
 
153 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0068  hypothetical protein  30.43 
 
 
152 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3642  hypothetical protein  32.38 
 
 
154 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1096  hypothetical protein  28.68 
 
 
157 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0081  membrane protein-like protein  30.91 
 
 
154 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2104  membrane protein-like protein  26.21 
 
 
194 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119024  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1339  hypothetical protein  28.97 
 
 
158 aa  50.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.23161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2883  membrane protein-like protein  28.45 
 
 
151 aa  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000154879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1400  membrane protein-like protein  28.32 
 
 
151 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3166  hypothetical protein  27.13 
 
 
157 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0546  membrane protein-like protein  28.28 
 
 
145 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>