30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0162 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0162  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  858    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.95694 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1253  hypothetical protein  60.33 
 
 		 425 aa  520  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.387075  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1512  hypothetical protein  30.84 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.300863  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2020  hypothetical protein  41.09 
 
 		 466 aa  97.8  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.413086  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  32.48 
 
 		 417 aa  97.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1785  hypothetical protein  34.29 
 
 		 465 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1387  YHS domain protein  30.92 
 
 		 466 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1832  hypothetical protein  40.31 
 
 		 467 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1651  hypothetical protein  40.31 
 
 		 467 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1168  conserved hypothetical integral membrane protein (YHS domain protein)  32.37 
 
 		 473 aa  94.7  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.657748  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2807  YHS  38.17 
 
 		 489 aa  93.6  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0526  integral membrane protein  28.83 
 
 		 454 aa  91.3  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0035517  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2139  YHS domain-containing protein  38.58 
 
 		 469 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2134  YHS domain-containing protein  38.58 
 
 		 469 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2249  YHS domain-containing protein  38.58 
 
 		 469 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0448  integral membrane protein  25.81 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.215453  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0431  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA(glucose-inhibited division protein A)  25.42 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00706476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3547  membrane protein-like protein  29.85 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0765  hypothetical protein  37.8 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3642  hypothetical protein  28.38 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0068  hypothetical protein  31.67 
 
 		 152 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1554  hypothetical protein  26.67 
 
 		 177 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0915  membrane protein-like protein  26.97 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0081  membrane protein-like protein  30.87 
 
 		 154 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1339  hypothetical protein  29.13 
 
 		 158 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.23161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2104  membrane protein-like protein  33.73 
 
 		 194 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119024  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2064  hypothetical protein  31.58 
 
 		 153 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1096  hypothetical protein  30.43 
 
 		 157 aa  50.8  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3166  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0546  membrane protein-like protein  29.67 
 
 		 145 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>