32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0526 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0526  integral membrane protein  100 
 
 		 454 aa  902    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0035517  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0448  integral membrane protein  47.92 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.215453  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0765  hypothetical protein  44.35 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0431  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA(glucose-inhibited division protein A)  44.2 
 
 		 455 aa  388  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00706476  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1168  conserved hypothetical integral membrane protein (YHS domain protein)  40.47 
 
 		 473 aa  288  2e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.657748  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1651  hypothetical protein  37.5 
 
 		 467 aa  269  8e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1832  hypothetical protein  37.28 
 
 		 467 aa  266  5.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2020  hypothetical protein  37.06 
 
 		 466 aa  257  3e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.413086  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2807  YHS  37.64 
 
 		 489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1785  hypothetical protein  35.94 
 
 		 465 aa  186  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2134  YHS domain-containing protein  35.62 
 
 		 469 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2249  YHS domain-containing protein  35.62 
 
 		 469 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2139  YHS domain-containing protein  35.62 
 
 		 469 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1387  YHS domain protein  36.94 
 
 		 466 aa  180  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  25.94 
 
 		 417 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1512  hypothetical protein  32.34 
 
 		 422 aa  87.8  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.300863  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3547  membrane protein-like protein  41.51 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0162  hypothetical protein  36 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.95694 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1253  hypothetical protein  44.94 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.387075  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1554  hypothetical protein  28.19 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1096  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3166  hypothetical protein  32.56 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0915  membrane protein-like protein  28.77 
 
 		 191 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0068  hypothetical protein  33.98 
 
 		 152 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2064  hypothetical protein  28.69 
 
 		 153 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0081  membrane protein-like protein  31.37 
 
 		 154 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1339  hypothetical protein  32.74 
 
 		 158 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.23161  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3642  hypothetical protein  31.78 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0546  membrane protein-like protein  32.29 
 
 		 145 aa  57  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2104  membrane protein-like protein  31.31 
 
 		 194 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119024  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1400  membrane protein-like protein  25.83 
 
 		 151 aa  47  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00099405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2883  membrane protein-like protein  31.07 
 
 		 151 aa  47  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000154879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>