26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0724 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  50 
 
 		 235 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  35.5 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3551  hypothetical protein  43.89 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781941  hitchhiker  0.00439118 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  40.12 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2855  protein of unknown function UPF0153  40.12 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.671622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2950  protein of unknown function UPF0153  38.42 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0053762  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3044  protein of unknown function UPF0153  40.57 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0010524  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2864  hypothetical protein  38.42 
 
 		 233 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.246141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4145  hypothetical protein  33.75 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770475 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  31.18 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0219  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  61.6  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215959  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  33.85 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1110  hypothetical protein  32.77 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  34.95 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  33.98 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  33.67 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  36.43 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  36.14 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2626  protein of unknown function UPF0153  36.36 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.135638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  33.01 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  27.36 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1894  hypothetical protein  34.23 
 
 		 229 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1299  hypothetical protein  34.92 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2957  hypothetical protein  32.61 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1293  protein of unknown function UPF0153  28.95 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.73928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>