24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0478 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0478  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  315  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  82.12 
 
 		 363 aa  265  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0941  rubrerythrin  66.89 
 
 		 153 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00913013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1416  Rubrerythrin  59.6 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10412e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3289  hypothetical protein  28.08 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0828  Rubrerythrin  26.03 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4415  rubrerythrin  26.62 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3238  rubrerythrin  27.21 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000130067  normal  0.0238915 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0583  Rubrerythrin  24.83 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  28.78 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  28.97 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1897  hypothetical protein  31.43 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00778692  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  25.17 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  29.25 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  26.62 
 
 		 1005 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1642  hypothetical protein  24.65 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  25.66 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0477  Rubrerythrin  24.52 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1880  Rubrerythrin  25.17 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2340  Rubrerythrin  25.83 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000319292  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  25.33 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3938  Rubrerythrin  25.33 
 
 		 165 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.691513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1311  Rubrerythrin  28.06 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000177343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1750  rubrerythrin  25.34 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.386737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>