More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1511 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2730  peptidase M16 domain protein  97.16 
 
 
424 aa  858    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.584644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1511  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
424 aa  880    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0037  processing peptidase  67.92 
 
 
424 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  41.32 
 
 
432 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2117  processing peptidase  39.27 
 
 
429 aa  296  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2975  peptidase M16 domain protein  38.62 
 
 
418 aa  293  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000177641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1309  peptidase M16 domain protein  38.36 
 
 
418 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00910612  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1562  Zn-dependent peptidase  37.68 
 
 
419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000390885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1907  peptidase M16 domain-containing protein  36.71 
 
 
419 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0978353  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1594  M16 family peptidase  36.71 
 
 
418 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.326709  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3323  processing peptidase  36.75 
 
 
441 aa  273  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390474  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  36.76 
 
 
413 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1592  peptidase M16-like  36.14 
 
 
418 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0267121  normal  0.0196738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  37.06 
 
 
435 aa  269  8e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1235  processing peptidase  35.24 
 
 
418 aa  266  7e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14700  predicted Zn-dependent peptidase  35.87 
 
 
453 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.2427  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  35.68 
 
 
418 aa  260  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2084  peptidase M16 domain-containing protein  35.98 
 
 
429 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2147  peptidase M16 domain-containing protein  35.98 
 
 
429 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2101  peptidase M16-like protein  35.98 
 
 
429 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0527778  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  35.77 
 
 
413 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0785  mitochondrial processing peptidase  37.53 
 
 
462 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  33.17 
 
 
424 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1190  peptidase M16 domain-containing protein  35.5 
 
 
477 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0547363  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3582  peptidase M16 domain protein  36.79 
 
 
444 aa  252  9.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7875  processing peptidase  34.09 
 
 
439 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4022  peptidase M16 domain-containing protein  35.26 
 
 
424 aa  250  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0571342 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1507  peptidase M16 domain-containing protein  34.83 
 
 
451 aa  249  6e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.583967  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2351  peptidase M16 domain-containing protein  35.52 
 
 
451 aa  249  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472755 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12795  zinc protease pepR  35.26 
 
 
438 aa  249  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  34.99 
 
 
413 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2133  peptidase M16 domain protein  37.94 
 
 
436 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.765752 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  34.74 
 
 
413 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  34.74 
 
 
413 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  34.74 
 
 
413 aa  246  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  34.99 
 
 
412 aa  246  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  34.74 
 
 
413 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  34.74 
 
 
413 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  32.13 
 
 
411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  34.49 
 
 
413 aa  246  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  34.74 
 
 
413 aa  245  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1435  peptidase M16 domain-containing protein  33.33 
 
 
447 aa  246  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  34.74 
 
 
413 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4314  peptidase M16 domain-containing protein  34.47 
 
 
421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518498  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  33.91 
 
 
423 aa  242  9e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  34.52 
 
 
421 aa  242  9e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  33.66 
 
 
420 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23370  predicted Zn-dependent peptidase  32.93 
 
 
441 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0226628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0840  putative zinc protease  34.79 
 
 
429 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1440  peptidase M16 domain protein  32.66 
 
 
447 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3148  processing peptidase  36.04 
 
 
419 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0678  peptidase M16 domain-containing protein  35.2 
 
 
424 aa  239  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.614007  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0910  processing peptidase  33.93 
 
 
422 aa  239  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0230  peptidase M16  34.15 
 
 
429 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1218  peptidase M16 domain protein  33.25 
 
 
442 aa  239  8e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.37886  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3554  processing peptidase  34.24 
 
 
467 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106365  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  33.17 
 
 
462 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2477  peptidase M16 domain protein  33.82 
 
 
445 aa  237  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424609  normal  0.386088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  32.68 
 
 
429 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  33.33 
 
 
466 aa  237  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1026  processing peptidase  31.78 
 
 
439 aa  236  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0908  peptidase M16 domain protein  32.2 
 
 
429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0823  peptidase M16-like  31.95 
 
 
429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1519  peptidase M16 domain protein  34.52 
 
 
441 aa  234  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2222  peptidase M16 domain protein  33.08 
 
 
451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000128075  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  34.96 
 
 
399 aa  233  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1568  peptidase M16-like  31.41 
 
 
425 aa  233  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000011969  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  34.26 
 
 
422 aa  232  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  32.91 
 
 
419 aa  232  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5822  peptidase M16 domain protein  35.73 
 
 
461 aa  232  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  32.25 
 
 
418 aa  232  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0481  processing peptidase  33.93 
 
 
419 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4796  peptidase M16-like  31.71 
 
 
429 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1832  M16 family peptidase  33.93 
 
 
419 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0263  peptidase M16-like  31.95 
 
 
429 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.736782  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0621  processing peptidase  32.65 
 
 
419 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1467  peptidase M16 domain protein  32.52 
 
 
457 aa  227  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1147  processing peptidase  33.25 
 
 
426 aa  227  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  32.23 
 
 
417 aa  226  6e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0309  processing peptidase  33.58 
 
 
421 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0115276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3176  peptidase M16 domain-containing protein  34.06 
 
 
453 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3953  peptidase M16 domain protein  33.17 
 
 
459 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870658  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07110  predicted Zn-dependent peptidase  33.25 
 
 
439 aa  223  4.9999999999999996e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.54818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  32.74 
 
 
422 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0269  peptidase M16 domain protein  33.25 
 
 
431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0535  processing peptidase  32.19 
 
 
434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3449  processing peptidase  34.04 
 
 
431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847529  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2329  peptidase  32.48 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124129  normal  0.969107 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1444  processing peptidase  32.57 
 
 
421 aa  219  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  32.75 
 
 
438 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3253  processing peptidase  33.8 
 
 
431 aa  219  7e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3577  processing peptidase  33.8 
 
 
431 aa  219  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1786  processing peptidase  31.73 
 
 
421 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.41523  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1252  peptidase M16 domain protein  35.09 
 
 
421 aa  216  8e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1637  processing peptidase  30.39 
 
 
418 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1419  processing peptidase  29.37 
 
 
424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0634  peptidase M16 domain protein  33.09 
 
 
432 aa  213  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3525  peptidase M16 domain-containing protein  32.6 
 
 
421 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.855558  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2340  processing peptidase  32.85 
 
 
431 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.348853  normal  0.675898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1589  processing peptidase  34.19 
 
 
431 aa  211  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0398438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>