More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0581 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0581  Ste24 endopeptidase  100 
 
 
419 aa  842    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00216679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0568  peptidase M48 Ste24p  92.84 
 
 
419 aa  791    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0109  peptidase M48, Ste24p  61.54 
 
 
421 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000135832  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0671  Ste24 endopeptidase  59.66 
 
 
424 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.188176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0318  M48 family peptidase  56.93 
 
 
414 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3199  Ste24 endopeptidase  56.14 
 
 
420 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1393  putative FtsZ-like Zn-dependent protease  45.69 
 
 
425 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.222302  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1388  Ste24 endopeptidase  39.76 
 
 
435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.165518  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1511  Ste24 endopeptidase  41.55 
 
 
422 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1607  Ste24 endopeptidase  38.26 
 
 
416 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1512  Ste24 endopeptidase  38.98 
 
 
416 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00450516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2357  Ste24 endopeptidase  38.56 
 
 
411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284177  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1469  Ste24 endopeptidase  39.6 
 
 
429 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.365872  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2695  Ste24 endopeptidase  41.85 
 
 
437 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3347  Ste24 endopeptidase  41.35 
 
 
437 aa  265  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0410765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5337  Ste24 endopeptidase  41.57 
 
 
675 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296038  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1277  Ste24 endopeptidase  36.98 
 
 
417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0166369  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2575  peptidase M48, Ste24p  39.45 
 
 
469 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.958701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1482  Ste24 endopeptidase  40.4 
 
 
421 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1993  Ste24 endopeptidase  38.26 
 
 
428 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2782  Ste24 endopeptidase  39.39 
 
 
414 aa  250  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0524  Ste24 endopeptidase  36.06 
 
 
417 aa  250  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0944212  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0984  Ste24 endopeptidase  37.37 
 
 
427 aa  249  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2454  Ste24 endopeptidase  38.77 
 
 
414 aa  249  7e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1699  Ste24 endopeptidase  40.25 
 
 
429 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2969  Ste24 endopeptidase  38.42 
 
 
419 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.22669 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1015  M48 family peptidase  38.17 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0941  CAAX prenyl protease 1, putative  36.19 
 
 
422 aa  243  7e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0957  Ste24 endopeptidase  36.57 
 
 
419 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.819496  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0953  Ste24 endopeptidase  36.57 
 
 
419 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1892  Ste24 endopeptidase  38.48 
 
 
453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35497  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0598  Ste24 endopeptidase  36.57 
 
 
419 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1077  Ste24 endopeptidase  36.57 
 
 
419 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1605  Ste24 endopeptidase  37.18 
 
 
412 aa  240  4e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2347  Ste24 endopeptidase  36.46 
 
 
410 aa  240  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3002  peptidase M48, Ste24p  36.87 
 
 
416 aa  239  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891499  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1036  Ste24 endopeptidase  36.32 
 
 
419 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0181  Ste24 endopeptidase  37.24 
 
 
408 aa  239  6.999999999999999e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0538  M48 family peptidase  37.5 
 
 
453 aa  239  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4191  Ste24 endopeptidase  37.08 
 
 
419 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28833  predicted protein  35.18 
 
 
464 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.841033  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1728  Ste24 endopeptidase  37.95 
 
 
415 aa  236  8e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2849  M48 family peptidase  38.32 
 
 
419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2959  peptidase  38.32 
 
 
419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1716  Ste24 endopeptidase  35.04 
 
 
428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1669  M48 family peptidase  38.32 
 
 
419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1474  Ste24 endopeptidase  35.8 
 
 
418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.493815  normal  0.267224 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2909  M48 family peptidase  38.32 
 
 
419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0941  integral membrane protease transmembrane protein  38.93 
 
 
418 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0177429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2912  Ste24 endopeptidase  39.15 
 
 
422 aa  232  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0495  Ste24 endopeptidase  36.45 
 
 
413 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0909  M48 family peptidase  38.38 
 
 
421 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0393  M48 family peptidase  38.38 
 
 
421 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980024  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0238  M48 family peptidase  38.38 
 
 
421 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0883  Ste24 endopeptidase  37.91 
 
 
422 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2536  M48 family peptidase  38.38 
 
 
421 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453397  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0906  Ste24 endopeptidase  37.81 
 
 
427 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0812  Ste24 endopeptidase  37.4 
 
 
419 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.46972  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1513  Ste24 endopeptidase  35.66 
 
 
421 aa  228  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0713  Ste24 endopeptidase  35.28 
 
 
418 aa  227  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.442824  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2226  Ste24 endopeptidase  38.07 
 
 
419 aa  225  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0777  Ste24 endopeptidase  36.68 
 
 
419 aa  222  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0537481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1411  Ste24 endopeptidase  38.48 
 
 
425 aa  219  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1027  Ste24 endopeptidase  35.71 
 
 
418 aa  218  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0632  Ste24 endopeptidase  34.44 
 
 
415 aa  218  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.035842  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2401  Ste24 endopeptidase  34.99 
 
 
415 aa  218  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0359  Ste24 endopeptidase  33.95 
 
 
406 aa  211  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0342  Ste24 endopeptidase  34.95 
 
 
418 aa  209  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1350  Ste24 endopeptidase  38.75 
 
 
421 aa  208  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1902  Ste24 endopeptidase  34.53 
 
 
419 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0130115  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1393  Zn-dependent protease with chaperone function  33.17 
 
 
418 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.498357 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0070  Ste24 endopeptidase  35.68 
 
 
427 aa  202  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2331  Ste24 endopeptidase  33.51 
 
 
405 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0205695 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0323  Ste24 endopeptidase  36.59 
 
 
434 aa  195  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.592332  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1820  M48 family peptidase  35.42 
 
 
399 aa  194  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.836146  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08781  CAAX prenyl protease 1, putative  33.42 
 
 
411 aa  193  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35752  zinc metalloprotease  32.27 
 
 
452 aa  192  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998958  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11231  CaaX prenyl protease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI78]  30.6 
 
 
456 aa  190  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.306562 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1320  Ste24 endopeptidase  32.6 
 
 
433 aa  186  9e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.465026  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1431  Ste24 endopeptidase  31.63 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00867901  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1613  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 
400 aa  181  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0572  Ste24 endopeptidase  32.81 
 
 
389 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.209932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3217  Ste24 endopeptidase  30.03 
 
 
397 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1723  Ste24 endopeptidase  36.09 
 
 
375 aa  180  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1231  Ste24 endopeptidase  33.23 
 
 
413 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0560112  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1148  Ste24 endopeptidase  33.42 
 
 
406 aa  178  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0618  M48 family peptidase  29.97 
 
 
404 aa  177  4e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.360311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2951  Ste24 endopeptidase  30.95 
 
 
407 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0886  Ste24 endopeptidase  32.18 
 
 
410 aa  176  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.806997  normal  0.37973 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2585  peptidase M48 Ste24p  27.54 
 
 
440 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00439089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1403  Ste24 endopeptidase  28.23 
 
 
410 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000815793  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04910  metalloendopeptidase, putative  30.48 
 
 
460 aa  169  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1045  M48 family peptidase  28.79 
 
 
439 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1023  metalloprotease  28.79 
 
 
439 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1021  metalloprotease  29.72 
 
 
438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.969299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1124  M48 family peptidase  28.79 
 
 
422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1283  M48 family peptidase  29.95 
 
 
395 aa  167  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.741961  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1203  peptidase, M48 family  29.46 
 
 
421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.726235 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1280  peptidase, M48 family  28.61 
 
 
421 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.870615  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0542  M48 family peptidase  29.53 
 
 
399 aa  166  8e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>