20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0439 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0439  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 1090 aa  2208    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3076  TPR repeat-containing protein  72.62 
 
 		 1108 aa  1534    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0542  hypothetical protein  38.16 
 
 		 922 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348097  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1225  hypothetical protein  39.93 
 
 		 941 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3566  coenzyme A biosynthesis protein  32 
 
 		 957 aa  459  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1813  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 		 952 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2960  cellulose binding, type IV  30.4 
 
 		 952 aa  368  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1601  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 939 aa  253  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1229  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 1016 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.748097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3961  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.18 
 
 		 1058 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.357683  normal  0.258592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3386  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 		 1162 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3466  TPR repeat-containing protein  23.03 
 
 		 1191 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.87 
 
 		 1192 aa  97.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215973  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3322  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 		 1193 aa  95.1  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2491  Tetratricopeptide repeat protein  20.16 
 
 		 1155 aa  68.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.694417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6495  Tetratricopeptide repeat protein  24.35 
 
 		 1202 aa  49.3  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.87 
 
 		 248 aa  45.8  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  38.46 
 
 		 245 aa  45.8  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2246  TPR repeat-containing protein  19.61 
 
 		 1004 aa  45.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2327  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 1023 aa  45.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.930727  normal  0.708749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>