More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7288 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
807 aa  1551    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  54.18 
 
 
863 aa  347  6e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  53.9 
 
 
892 aa  317  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  54.14 
 
 
737 aa  308  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6773  serine/threonine protein kinase  56.96 
 
 
518 aa  299  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117813  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  57.1 
 
 
719 aa  283  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  55.06 
 
 
772 aa  269  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  47.66 
 
 
716 aa  263  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  51.45 
 
 
770 aa  255  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  46.26 
 
 
732 aa  236  9e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4910  serine/threonine protein kinase  45.14 
 
 
552 aa  236  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104206  decreased coverage  0.00224255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  51.77 
 
 
682 aa  234  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  50.17 
 
 
756 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0242  serine/threonine protein kinase  48.55 
 
 
295 aa  213  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443533 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  40.68 
 
 
612 aa  184  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  39.93 
 
 
1030 aa  183  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  37.73 
 
 
651 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  41.26 
 
 
620 aa  174  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  44.96 
 
 
468 aa  172  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.27 
 
 
632 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  40 
 
 
1057 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  40.07 
 
 
666 aa  171  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.81 
 
 
602 aa  170  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  42.18 
 
 
850 aa  170  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  38.36 
 
 
1053 aa  169  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  41.03 
 
 
763 aa  169  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  40.81 
 
 
593 aa  168  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  40.53 
 
 
646 aa  167  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.8 
 
 
641 aa  167  6.9999999999999995e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.02 
 
 
584 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.3 
 
 
667 aa  166  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.46 
 
 
598 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  39.56 
 
 
776 aa  164  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  40.38 
 
 
618 aa  164  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  40.6 
 
 
450 aa  164  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 
691 aa  163  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0382  serine/threonine protein kinase  38.25 
 
 
583 aa  163  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  36.19 
 
 
692 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  41.82 
 
 
1750 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.41 
 
 
658 aa  162  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 
746 aa  161  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
612 aa  161  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40 
 
 
614 aa  160  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.94 
 
 
579 aa  160  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.9 
 
 
627 aa  160  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.1 
 
 
645 aa  160  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  40.74 
 
 
468 aa  160  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  38.44 
 
 
614 aa  160  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.34 
 
 
591 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.16 
 
 
627 aa  159  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  37.26 
 
 
621 aa  158  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  37.76 
 
 
951 aa  159  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  34.21 
 
 
1351 aa  157  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.79 
 
 
499 aa  157  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  33.25 
 
 
641 aa  157  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.23 
 
 
662 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  39.93 
 
 
480 aa  156  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0158  serine/threonine protein kinase  35.39 
 
 
557 aa  157  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.1 
 
 
520 aa  156  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.23 
 
 
715 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  37.19 
 
 
596 aa  156  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0362  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
632 aa  156  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.66 
 
 
668 aa  156  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  38.91 
 
 
520 aa  156  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3065  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  40.91 
 
 
499 aa  155  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.648627  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  37.4 
 
 
825 aa  155  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  35.42 
 
 
692 aa  155  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  36.03 
 
 
638 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  38.49 
 
 
618 aa  154  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  38.64 
 
 
1034 aa  154  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.26 
 
 
653 aa  154  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  39.36 
 
 
617 aa  154  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  35.69 
 
 
894 aa  154  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  39.93 
 
 
464 aa  153  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  39.02 
 
 
611 aa  153  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  40.15 
 
 
382 aa  152  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  33.64 
 
 
625 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  39.78 
 
 
613 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  37.76 
 
 
863 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  34.26 
 
 
503 aa  152  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  37.63 
 
 
1073 aa  152  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  37.83 
 
 
628 aa  151  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.95 
 
 
518 aa  151  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6755  serine/threonine protein kinase  36.95 
 
 
597 aa  151  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.7 
 
 
740 aa  151  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1202  serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 
655 aa  151  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5101  serine/threonine protein kinase  38.18 
 
 
996 aa  150  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0112  protein kinase  42.66 
 
 
469 aa  151  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351579  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  38.57 
 
 
572 aa  150  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1403  serine/threonine protein kinase  39.08 
 
 
642 aa  150  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 
559 aa  150  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0510  serine/threonine protein kinase  40.34 
 
 
661 aa  150  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  34.42 
 
 
651 aa  150  9e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  37.2 
 
 
776 aa  150  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  38.87 
 
 
599 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0171  serine/threonine protein kinase  34.49 
 
 
575 aa  150  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.495174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  38.19 
 
 
586 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 
425 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  35.36 
 
 
667 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 
703 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>