55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3162 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3162  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  233  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5739  transposase IS4 family protein  54.32 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7677  transposase IS4 family protein  49.38 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1566  IS4 family transposase  49.38 
 
 		 262 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6412  IS4 family transposase  49.38 
 
 		 262 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510008  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6468  IS4 family transposase  49.38 
 
 		 262 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572401  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0555  ISJP4 transposase  43.64 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0733483  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  49.38 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  48.19 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  48.19 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  48.19 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  48.19 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  48.19 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  48.19 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  48.19 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  46.99 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  63.86 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0173  transposase, IS4 family protein  45.78 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  63.86 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  62.65 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  62.65 
 
 		 267 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0042  TIS1421-transposase protein B  46.91 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1671  TIS1421-transposase protein B  46.91 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0971457  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0093  TIS1421-transposase protein B  46.91 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0301  TIS1421-transposase protein A  46.91 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00123351 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0582  IS1421-transposase protein B  46.91 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0991  TIS1421-transposase protein B  46.91 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.308631  normal  0.0376658 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  45.78 
 
 		 268 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  39.51 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  39.51 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  39.51 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0093  transposase, IS4 family protein  41.98 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1908  transposase, IS4 family protein  41.98 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.221251  decreased coverage  0.000248435 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17380  transposase family protein  38.55 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1734  transposase, IS4 family protein  41.77 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  42.68 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  42.68 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  41.67 
 
 		 274 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  49.37 
 
 		 296 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3504  transposase, IS4 family protein  37.8 
 
 		 179 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3094  transposase, IS4 family protein  46.97 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0335819  normal  0.853001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2524  transposase, IS4 family protein  46.97 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3622  transposase, IS4 family protein  46.97 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968819  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2047  transposase, IS4 family protein  46.97 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4477  transposase, IS4 family protein  46.97 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.164245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3722  transposase, IS4 family protein  46.97 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0136631  hitchhiker  0.000781159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1726  transposase, IS4 family protein  46.97 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3631  transposase, IS4 family protein  46.97 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411326  normal  0.17845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  48.1 
 
 		 216 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  43.33 
 
 		 303 aa  43.9  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  43.33 
 
 		 303 aa  43.9  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  43.33 
 
 		 303 aa  43.9  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  31.88 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  37.88 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  37.88 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>