More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2604 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1801  aldo/keto reductase  85.67 
 
 
394 aa  640    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.672115  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2604  aldo/keto reductase  100 
 
 
366 aa  743    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3654  aldo/keto reductase  54.65 
 
 
350 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4586  aldo/keto reductase  32.73 
 
 
330 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00281248  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1156  aldo/keto reductase  31.14 
 
 
331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1004  aldo/keto reductase  31.5 
 
 
331 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0837346  normal  0.566721 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  29.77 
 
 
309 aa  119  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  29.28 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3323  aldo/keto reductase  32.69 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  28.7 
 
 
308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  27.68 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  24.36 
 
 
326 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  27.97 
 
 
314 aa  109  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3557  aldo/keto reductase  31.59 
 
 
335 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.729958  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  31.23 
 
 
330 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0553  aldo/keto reductase  29.85 
 
 
324 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0539  aldo/keto reductase  29.85 
 
 
324 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7726  aldo/keto reductase  28.65 
 
 
347 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  25.85 
 
 
312 aa  106  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  27.13 
 
 
315 aa  106  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  25.3 
 
 
312 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  25.3 
 
 
312 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.72 
 
 
327 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1282  aldo/keto reductase  30.86 
 
 
346 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  26.02 
 
 
326 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.55 
 
 
312 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.02 
 
 
326 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  26.02 
 
 
326 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.02 
 
 
326 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2093  aldo/keto reductase  28.78 
 
 
322 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461089  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  26.63 
 
 
319 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  26.63 
 
 
319 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.02 
 
 
326 aa  100  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  25.73 
 
 
326 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  27.41 
 
 
327 aa  99  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.73 
 
 
326 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1279  aldo/keto reductase  25.98 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0530409  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1920  aldo/keto reductase  25.53 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  27.54 
 
 
341 aa  97.8  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2390  aldo/keto reductase  27.91 
 
 
336 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000519885  hitchhiker  0.000458148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  26.57 
 
 
327 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  29.2 
 
 
326 aa  96.7  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  26.38 
 
 
315 aa  96.7  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  29.81 
 
 
328 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  29.73 
 
 
329 aa  96.7  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  27.64 
 
 
328 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  29.45 
 
 
316 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  27.04 
 
 
327 aa  95.9  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3566  aldo/keto reductase  26.1 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  28.4 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  23.46 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  26.06 
 
 
319 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3927  aldo/keto reductase  29.36 
 
 
321 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.124161 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1283  aldo/keto reductase  26.41 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  27.43 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  28.78 
 
 
341 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  23.87 
 
 
314 aa  94.4  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  25.81 
 
 
327 aa  94  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  28.7 
 
 
336 aa  94  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  26.73 
 
 
370 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.55 
 
 
311 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  26.65 
 
 
332 aa  93.6  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  27.25 
 
 
351 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  23.3 
 
 
330 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  24.85 
 
 
311 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2875  aldo/keto reductase  26.13 
 
 
323 aa  92.8  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.536931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  29.2 
 
 
329 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0797  aldo/keto reductase  25.8 
 
 
368 aa  92.4  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.138873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  29.43 
 
 
313 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  25.98 
 
 
317 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  29.43 
 
 
329 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2022  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.21 
 
 
317 aa  92.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.37723  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0869  aldo/keto reductase  29.71 
 
 
325 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  25.61 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2991  aldo/keto reductase  25.83 
 
 
325 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0544  aldo/keto reductase  26.72 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  25.57 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  26.76 
 
 
332 aa  91.3  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0434  aldo/keto reductase  27.16 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  30.12 
 
 
313 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  23.37 
 
 
327 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  25.07 
 
 
323 aa  90.5  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  21.73 
 
 
319 aa  90.5  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6681  aldo/keto reductase  27.71 
 
 
349 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210539  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0869  putative oxidoreductase  26.69 
 
 
325 aa  90.1  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4206  lolS protein  24.7 
 
 
304 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.510794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.25 
 
 
332 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  26.55 
 
 
319 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2669  aldo/keto reductase  28.33 
 
 
334 aa  89.7  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000580906  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  26.14 
 
 
312 aa  89.7  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  28.82 
 
 
337 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  24.12 
 
 
315 aa  89.4  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  28.53 
 
 
323 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  25.73 
 
 
327 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  26.57 
 
 
320 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  26.55 
 
 
349 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  27.99 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6147  aldo/keto reductase  26.16 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2569  aldo/keto reductase  29.25 
 
 
359 aa  89.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2706  aldo/keto reductase  24.62 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.315446  normal  0.0513811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>