More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3654 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3654  aldo/keto reductase  100 
 
 
350 aa  704    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1801  aldo/keto reductase  58.24 
 
 
394 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.672115  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2604  aldo/keto reductase  54.65 
 
 
366 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  31.94 
 
 
330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4586  aldo/keto reductase  31.23 
 
 
330 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00281248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  29.97 
 
 
314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0553  aldo/keto reductase  31.42 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0539  aldo/keto reductase  31.42 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.65 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  28.65 
 
 
326 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  28.65 
 
 
326 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.94 
 
 
326 aa  126  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  28.37 
 
 
326 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.37 
 
 
326 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.37 
 
 
326 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  26.88 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  27.01 
 
 
315 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  27.14 
 
 
317 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0869  putative oxidoreductase  28.96 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  29.68 
 
 
349 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0514  aldo/keto reductase  28.93 
 
 
332 aa  116  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  29.11 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.74 
 
 
312 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1711  aldo/keto reductase  31.34 
 
 
340 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.97 
 
 
327 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3323  aldo/keto reductase  31.67 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0599  aldo/keto reductase  28.17 
 
 
345 aa  113  6e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  30.79 
 
 
312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1282  aldo/keto reductase  33.88 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  27.76 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  28.74 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  28.96 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  29.22 
 
 
370 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  27.16 
 
 
308 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  27.54 
 
 
312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1744  aldo/keto reductase  26.96 
 
 
351 aa  109  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  30.12 
 
 
351 aa  109  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  28.14 
 
 
351 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  28.14 
 
 
351 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  29.22 
 
 
351 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1156  aldo/keto reductase  29.23 
 
 
331 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3557  aldo/keto reductase  32.63 
 
 
335 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.729958  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  29.72 
 
 
322 aa  109  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3518  aldo/keto reductase  28.74 
 
 
324 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  26.65 
 
 
337 aa  108  9.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1479  putative oxidoreducatse  29.04 
 
 
326 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  29.82 
 
 
327 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.02 
 
 
311 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.22 
 
 
311 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  26.57 
 
 
308 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0667  aldo/keto reductase  28.44 
 
 
302 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1279  aldo/keto reductase  25.9 
 
 
339 aa  107  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0530409  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1813  aldo/keto reductase  27.33 
 
 
329 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0383943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1620  aldo/keto reductase  27.33 
 
 
329 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.884834  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.22 
 
 
311 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  29.72 
 
 
323 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  28.2 
 
 
309 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  28.75 
 
 
316 aa  106  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  28.18 
 
 
312 aa  106  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.81 
 
 
311 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  28.18 
 
 
312 aa  106  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  28.99 
 
 
359 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1004  aldo/keto reductase  28.99 
 
 
331 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0837346  normal  0.566721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  30.75 
 
 
328 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  26.2 
 
 
326 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  25.82 
 
 
311 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2390  aldo/keto reductase  27.95 
 
 
336 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000519885  hitchhiker  0.000458148 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0379  aldo/keto reductase  25.98 
 
 
314 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0161187  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  27.41 
 
 
333 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0797  aldo/keto reductase  27.07 
 
 
368 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.138873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.93 
 
 
311 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  24.7 
 
 
326 aa  104  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.93 
 
 
311 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  24.93 
 
 
311 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1031  lolS protein  25.62 
 
 
304 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4165  lolS protein  24.92 
 
 
304 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3242  aldo/keto reductase  27.11 
 
 
327 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.93 
 
 
311 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.23 
 
 
311 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  26.67 
 
 
315 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  29.33 
 
 
355 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  26.25 
 
 
306 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4424  aldo/keto reductase  28.91 
 
 
335 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00178858  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2410  aldo/keto reductase  32.56 
 
 
331 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0936644  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2071  aldo/keto reductase  25.73 
 
 
316 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0765419  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  28.97 
 
 
327 aa  102  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3852  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.08 
 
 
304 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  29.75 
 
 
331 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3949  aldo/keto reductase  24.21 
 
 
334 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  25.71 
 
 
304 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3542  aldo/keto reductase  27.95 
 
 
332 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0604  aldo/keto reductase  22.97 
 
 
319 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106884  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  29 
 
 
319 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1920  aldo/keto reductase  27.76 
 
 
319 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  28.83 
 
 
345 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1392  aldo/keto reductase  26.65 
 
 
323 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203744  hitchhiker  0.00446461 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4206  lolS protein  25.62 
 
 
304 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.510794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  32.66 
 
 
331 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0618  aldo/keto reductase  22.97 
 
 
319 aa  100  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000265496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2046  aldo/keto reductase  30.47 
 
 
325 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>