30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2478 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2478  hypothetical protein  100 
 
 		 585 aa  1144    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3028  methyltransferases-like  39.7 
 
 		 610 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2948  methyltransferase-like protein  38.65 
 
 		 516 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6272  protein of unknown function DUF43  38.39 
 
 		 519 aa  283  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30610  predicted methyltransferase  39.31 
 
 		 464 aa  272  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.603423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1172  methyltransferase  37.1 
 
 		 552 aa  226  8e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3167  protein of unknown function DUF43  34.34 
 
 		 600 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0142  hypothetical protein  35.32 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0957  hypothetical protein  34.43 
 
 		 396 aa  124  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1016  hypothetical protein  27.27 
 
 		 390 aa  123  7e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0929  hypothetical protein  33.88 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1087  protein of unknown function DUF43  30.93 
 
 		 391 aa  120  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1752  hypothetical protein  33.33 
 
 		 390 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.739696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0296  protein of unknown function DUF43  30.12 
 
 		 386 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1462  hypothetical protein  36.98 
 
 		 402 aa  101  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2044  hypothetical protein  35.78 
 
 		 383 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3346  hypothetical protein  35.32 
 
 		 384 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.909269  normal  0.156044 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1121  hypothetical protein  30.46 
 
 		 358 aa  76.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.36872  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0499  protein of unknown function DUF43  26.98 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2198  protein of unknown function DUF43  26.06 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000324238  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0209  protein of unknown function DUF43  32.28 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0242846  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0834  protein of unknown function DUF43  27.12 
 
 		 358 aa  66.6  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2257  hypothetical protein  31.06 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0106481  hitchhiker  0.00981057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3741  hypothetical protein  30.63 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0952103  normal  0.220518 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0154  protein of unknown function DUF43  26.52 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0533  protein of unknown function DUF43  27.67 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0036  hypothetical protein  25.51 
 
 		 279 aa  51.2  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  38.75 
 
 		 288 aa  47.8  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63940  hypothetical protein  42.86 
 
 		 263 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5395  hypothetical protein  22.84 
 
 		 281 aa  43.9  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>